草果遺傳多樣性分析及其混淆品的ITS序列差異比較研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的：草果Amomum tsaoko Crevost et Lemaire為姜科豆蔻屬多年生草本植物，果實為常用中藥材。對草果SSR分子標記進行研究，獲得草果SSR多態(tài)性引物和遺傳多樣性信息，為草果優(yōu)良種源的篩選奠定基礎；探尋草果與擬草果分子鑒別方法，為草果及其混淆品的分子鑒別奠定基礎。
　　 方法：(1)利用磁珠富集法對草果基因組中的微衛(wèi)星序列進行篩選分離，構建草果微衛(wèi)星富集文庫，得到草果微衛(wèi)星序列，運用Primer Prim

2、er5.0軟件進行分析設計引物，利用聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測引物多態(tài)性，最后選取多態(tài)性引物對草果進行遺傳多樣性分析(2)利用ITS分子標記對草果和混淆品擬草果A.paratsaokoS.Q.TongetY.M.Xia進行ITS分析，根據(jù)測序結果用生物信息學軟件(CExpress)進行序列比對，用MEGA軟件將CExpress產生的比對結果以鄰近法(Neighbor Joining)模型生成系統(tǒng)樹，揭示兩者遺傳結構的差異。
　　 結

3、果：(1)用開發(fā)出來的7對SSR引物對草果5個居群35個體進行遺傳多樣性分析，在物種水平上，7對SSR多態(tài)性引物共檢測到15個等位基因，基于15個等位基因獲得的遺傳多樣性的結果顯示：觀測雜合度(Ho)的變化范圍為0.0000～0.4000,平均值為0.3020；期望雜合度的值(He)變化范圍為0.2273～0.6704，平均值為0.3936；Shannon多樣性指數(shù)變化范圍為0.3837～1.0895，平均值為0.6012，Nei遺傳多

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