幾種雙殼貝類ITS區(qū)序列分析與遺傳多樣性研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、采用聚合酶鏈式反應(PCR)對采自日本半島、俄羅斯海參葳地區(qū)以及中國威海等三個自然群體的魁蚶樣本的核糖體RNA兩個轉(zhuǎn)錄間區(qū)域(ITS-1和ITS-2)進行了擴增,電泳檢測在500bp左右都得到了清晰的擴增產(chǎn)物條帶.PCR產(chǎn)物純化后與T載體連接,進行了克隆、測序.分別得到了長度為421bp和495bp(不含引物)的堿基序列,其中A,C,G,T含量分別為21.85﹪,25.87﹪,27.23﹪,25.04﹪;26.66﹪,22.18﹪,24

2、.04﹪,27.13﹪.ITS2片段序列中的AT含量明顯高于ITS1.魁蚶7個個體ITS2片段序列經(jīng)Gendoc軟件排序后檢測到兩個多態(tài)位點,3種單倍型;魁蚶7個個體間的遺傳距離為0-0.2﹪.魁蚶16個個體的ITS1片段去除引物排序后檢測到了9個多態(tài)性核苷酸位點,共7種單倍型;其中發(fā)生轉(zhuǎn)換突變的核苷酸位點數(shù)為4個,顛換突變位點2個.在三個群體中,通過計算不同個體間的遺傳距離構(gòu)建NJ和MP系統(tǒng)樹,16個個體沒有明顯的聚類現(xiàn)象.ITS1和

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