基于ITS及ndhF-rpl32序列的蕎麥多樣性研究.pdf

1、蕎麥（Buckwheat）是蓼科（Polygonaceae）蕎麥屬（Fagopyrum Mill）的雙子葉植物，由于其全面的營養(yǎng)成分和藥用價值，使得蕎麥的產品、制品已經深入到人們的日常生活。蕎麥作為一種小宗作物，目前在我國已命名的蕎麥共有23個種，其中，僅甜蕎和苦蕎兩個為栽培種，其余均為野生種，這些野生種大多分布在我國的西南地區(qū)。本研究基于核基因組中的ITS序列及葉綠體中的ndhF-rpl32序列對從我國西南地區(qū)收集到的10個（亞、變）

2、種及1個栽培苦蕎的變型共71份材料的遺傳多樣性進行研究，主要結果如下：
　　1.蕎麥 ITS和 ndhF-rpl32序列的特征：在 ITS序列中，變異主要發(fā)生在 ITS1區(qū)和 ITS2區(qū)，其信息位點所占比率分別為38.5％和43%，而5.8S的信息位點僅占10.3%；在ndhF-rpl32序列中，信息位點占19.6%。由此可見，5.8S rDNA比較保守，其次為ndhF-rpl32序列，ITS1和ITS2的變異程度較高。
　

3、　2.依據(jù)ITS和ndhF-rpl32序列構建的系統(tǒng)發(fā)育樹：本研究通過2種不同的算法來構建系統(tǒng)發(fā)育樹，分別為鄰接法和最大簡約法，采用鄰接法構建的2個系統(tǒng)發(fā)育樹都能將71份蕎麥材料分為大粒組和小粒組兩個類群，其中，大粒組類群包括栽培苦蕎、米苦蕎、野生甜蕎、栽培甜蕎、金蕎復合物。小粒種類群包括齒翅野蕎、疏穗小野蕎、小野蕎、密毛野蕎、細柄野蕎和硬枝萬年蕎。在大粒組類群中，金蕎復合物、栽培苦蕎(包括米苦蕎)、栽培甜蕎(包括野生甜蕎)又聚為三支；

4、在小粒組類群中，疏穗小野蕎可獨自形成一個分支，齒翅野蕎、小野蕎、密毛野蕎和細柄野蕎聚為一支。最大簡約法構建的系統(tǒng)發(fā)育樹中，金蕎復合物、栽培甜蕎（包括野生甜蕎）、栽培苦蕎（包括米苦蕎）、疏穗小野蕎均可以單獨聚為一支，但并不像鄰接法能將71份材料分為兩大類群。兩個方法構建系統(tǒng)發(fā)育樹各有優(yōu)勢，鄰接法適用于遺傳距離較小，信息位點比例小的短序列；最大簡約法適用于進化速率相近，同時信息位點比例高的長序列。
　　3.蕎麥屬植物的種間親緣關系：在

5、ITS和ndhF-rpl32序列中，無論是采用鄰接法還是最大簡約法，結果都顯示，栽培苦蕎和金蕎復合物之間的親緣關系較栽培甜蕎與金蕎復合物之間的親緣關系更近。小粒組中的齒翅野蕎、小野蕎、密毛野蕎和細柄野蕎這四個種的親緣關系較近，這與它們在形態(tài)學上的表現(xiàn)一致。在大粒組中，栽培苦蕎的變異完全覆蓋了米苦蕎，這與米苦蕎僅是栽培苦蕎的一個變異類型相符合；同時野生甜蕎與栽培甜蕎的親緣關系較近。
　　4.大粒組蕎麥ITS2序列的SNP位點分析：從