基于葉綠體序列rpl16的中國櫻桃居群遺傳多樣性及居群遺傳結(jié)構(gòu)研究.pdf

1、中國櫻桃（Cerasus pseudocerasus Lindl.）是起源于我國的落葉果樹，它隸屬于薔薇科(Rosaceae)李亞科(Prunoideae)櫻屬（Cerasus），約有3000余年的栽培歷史，其早熟性、觀賞性賦予了它很高的經(jīng)濟(jì)價值。中國櫻桃在我國有著廣闊的分布，在川、云、陜、貴分布著其豐富的野生資源，河南、安徽、四川、貴州、甘肅、重慶等省市分布著中國櫻桃的重要栽培種質(zhì)，但是目前關(guān)于中國櫻桃野生及栽培資源的遺傳背景還了解得

2、不夠全面、深入，影響了對中國櫻桃優(yōu)良種質(zhì)的保護(hù)和利用。鑒于此，本文采集了來自四川、安徽、河南、陜西、貴州、重慶等省市的263份中國櫻桃材料，包括9個中國櫻桃野生群體和8個中國櫻桃栽培群體，基于葉綠體序列rpl16內(nèi)含子區(qū)，展開了對中國櫻桃資源的遺傳多樣性評價和居群遺傳結(jié)構(gòu)分析，其結(jié)果如下:
　　1.中國櫻桃資源遺傳多樣性評價。17個群體的263個體的葉綠體片段序列遺傳多樣性研究結(jié)果表明:1)263條rpl16內(nèi)含子區(qū)序列共檢測到1

3、4個多態(tài)性位點(diǎn)，所有17個群體共檢測到22個葉綠體單倍型。單倍型多態(tài)性(Hd)分布范圍為0.000-0.879，總?cè)后w的單倍型多態(tài)性(Hd)為0.689。核苷酸多樣性（π）分布范圍為0.00000-0.00316，，總?cè)后w的核苷酸多樣性(π)為0.00184。2）不同群體類型之間的遺傳多樣性水平相差較大，其中野生群體擁有較高的遺傳多樣性水平，其平均單倍型多樣性Hd=0.776，核苷酸多樣性π=0.00258，而栽培群體的平均單倍型多樣性

4、水平Hd=0.575，核苷酸多樣性π=0.00076。中國櫻桃桃具有豐富的遺傳多樣性，這一結(jié)果與大多數(shù)研究結(jié)果是一致的，而栽培群體較低水平的遺傳多樣性形成的原因可能是由于長期的馴化栽培及無性繁殖引起的嚴(yán)重的瓶頸效應(yīng)使得其有效群體大小嚴(yán)重減小所導(dǎo)致的。
　　2.中國櫻桃的群體遺傳結(jié)構(gòu)。群體遺傳結(jié)構(gòu)研究結(jié)果表明:1）兩兩群體間遺傳分化結(jié)果顯示:17個中國櫻桃群體兩兩群體間的遺傳分化系數(shù)Fst的變化范圍為0.0000～0.8912，除野

5、生貴陽群體、野生青川群體、野生商南群體與各栽培群體間的遺傳分化系數(shù)較大，其余群體間遺傳分化系數(shù)相對較小，兩兩群體間遺傳分化不明顯;野生群體與栽培群體間的遺傳分化系數(shù)Fst=0.1558(P=0.0000)，雖然少數(shù)幾個野生群體與栽培群體間有較為明顯的遺傳分化，但在總體上看野生群體與栽培群體之間的遺傳分化并不明顯。2）分子差異分析(AMOVA)結(jié)果表明:中國櫻桃總?cè)后w與栽培群體的遺傳變異主要來源于群體內(nèi)，而栽培群體的遺傳變異有65.57％

6、來源于群體間，34.43％來源于群體內(nèi)。3）基于K-2P模型的遺傳距離結(jié)果顯示，17個群體兩兩之間的遺傳距離變化范圍為0.000～0.004，野生商南群體與其余群體的遺傳距離最遠(yuǎn)。基于K-2P模型遺傳距離的聚類分析中17個中國櫻桃群體主要被聚為兩個大支，野生青川群體與野生商南群體被聚為一支(Ⅱ)，其余群體被聚為另一支(Ⅰ)，說明野生青川群體與野生商南群體與其余群體遺傳距離較遠(yuǎn)。單倍型的NJ聚類圖與單倍型的網(wǎng)絡(luò)圖是單倍型關(guān)系結(jié)果的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)

7、，表明:22個單倍型分為了兩個大的分支A和B，A、B分枝分別包含了13和9個單倍型，大分枝A分為了A1和A2兩個亞枝，大分枝B分為了B1和B2兩個亞支。單倍型Hap1與Hap2是分布最廣的兩個單倍型，且有較高的頻率。4）中性檢驗(yàn)與錯配分析結(jié)果顯示:栽培群體的Tajiama's D為顯著的負(fù)值，且其錯配分布曲線是一個峰曲線，說明栽培群體是一個不穩(wěn)定群體，其偏離了中性進(jìn)化，近期經(jīng)歷過大規(guī)模的群體擴(kuò)張。由以上研究結(jié)果推知:中國櫻桃的繁育系統(tǒng)與