微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)序列分析哲羅野生群體的遺傳多樣性.pdf

1、上海海洋大學碩士學位論文碩士學位論文題目：目：微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)序列分析哲羅野生群體微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)序列分析哲羅野生群體的遺傳多樣性的遺傳多樣性英文題目：英文題目：AnalysisofGeicDiversityonSeveralWildStocksofTaimen(Huchotaimen)byMicrosatelliteMarkerstheControlRegionofMitochondrialDNA專業(yè)：業(yè)：水產(chǎn)養(yǎng)殖研究方向：研

2、究方向：水產(chǎn)動物遺傳與生態(tài)姓名：名：劉博指導教師指導教師：尹家勝二O一二一二年四月五日學校代碼：10264研究生學號：M090101045上海海洋大學碩士學位論文I微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)序列分析哲羅野生群體的遺傳多樣性微衛(wèi)星和線粒體控制區(qū)序列分析哲羅野生群體的遺傳多樣性摘要哲羅魚(Huchotaimen)屬鮭形目(Samonifmes)、鮭科(Salmonidea)、哲羅魚屬(Hucho)，是一種大型的珍稀冷水魚類，也是一種優(yōu)良的淡水養(yǎng)殖

3、品種。本研究利用微衛(wèi)星分子標記和DLOOP區(qū)序列分析技術研究了黑龍江流域幾個哲羅魚野生群體的遺傳多樣性，主要包括以下研究內(nèi)容：利用20對微衛(wèi)星標記對9個野生哲羅魚群體進行了分析。結(jié)果表明：9個哲羅魚群體的觀測雜合度在0.09940.8882之間，期望雜合度在0.20050.8759之間，PIC指數(shù)在0.34320.5261之間，其中呼瑪河群體的遺傳多樣性較低。群體間的Fst在0.02460.2333（P0.0001）之間，Nm在0.82

4、169.9292之間，群體間遺傳分化較明顯，基因交流少；各群體間的遷移率不一致，遷入率與遷出率不對稱，有大群體向小群體遷移的趨勢；群體的同胞系比例在27.78%90.91%之間，說明近交壓力較大，可能經(jīng)歷過遺傳瓶頸或存在這樣的風險；AMOVA分析表明群體間各基因座遺傳分化系數(shù)的均值為0.1081；聚類分析和遺傳組成分析結(jié)果均顯示呼瑪河群體與烏蘇里江群體聚為一支，黑龍江中上游群體聚為一支。通過設計特異性引物，采用PCR技術對10個野生哲羅

5、魚群體共42個個體的mtDNADloop區(qū)序列進行擴增，測序得到的序列進行比對，發(fā)現(xiàn)該42個序列長度變異較小，選取共555bp序列進行比對分析。采用MEGA(version4.0)和DnaSP(version4.0)軟件對序列進行分析，結(jié)果顯示：42條哲羅魚線粒體DLOOP序列中，A、T、G、C堿基的含量平均為30.2%，31.3%，15.8%和22.7%，和已報道的其他魚類的DLOOP堿基組成類似。42個個體表現(xiàn)為28種單倍型，包括2