烏鱧線粒體DNA控制區(qū)結(jié)構(gòu)分析及遺傳多樣性.pdf

1、本試驗(yàn)所用烏鱧自2012年9月至2013年11月,分別取自在河北省白洋淀,山東省平原縣和湖南省洞庭湖三個(gè)地區(qū),采集到野生群體(白洋淀、平原縣和洞庭湖)烏鱧標(biāo)本共計(jì)104尾,養(yǎng)殖群體(白洋淀和平原縣)烏鱧標(biāo)本共計(jì)64尾。經(jīng)過總DNA提取、PCR擴(kuò)增后共測序得到烏鱧線粒體控制區(qū)序列168條,在GenBank數(shù)據(jù)庫中檢索出烏鱧線粒體DNA全序列,與擴(kuò)增獲得的序列比對,確定烏鱧線粒體 D-Loop區(qū)的起止位點(diǎn),確定烏鱧線粒體D-Loop區(qū)序列全

2、長為905-908bp,長度變異較小。識(shí)別了烏鱧線粒體D-Loop區(qū)的終止序列區(qū)、中央保守區(qū)和保守序列區(qū),指出了終止相關(guān)序列的主體是TACAT與其反向互補(bǔ)序列ATGTA以及一系列保守序列(CSB-F、CSB-E、CSB-D和CSB-1、CSB-2、CSB-3)。
　　本研究通過對白洋淀和平原縣地區(qū)的烏鱧進(jìn)行野生群體與養(yǎng)殖群體的對比試驗(yàn),結(jié)果表明這兩個(gè)地區(qū)的野生群體遺傳多樣性參數(shù)均低于養(yǎng)殖群體。其中白洋淀烏鱧的野生群體和養(yǎng)殖群體間表

3、現(xiàn)出較大的遺傳差異,為兩個(gè)母系起源。平原縣的野生和養(yǎng)殖群體則表現(xiàn)為差異較小,揭示了兩群體間親緣關(guān)系較近。
　　烏鱧3個(gè)地理群體的遺傳多樣性表現(xiàn)為:洞庭湖群體>平原縣群體>白洋淀群體,3個(gè)烏鱧野生群體間和群體內(nèi)的核苷酸多樣性均低于0.005,表現(xiàn)為核苷酸多樣性較低的現(xiàn)象。其中白洋淀群體的相關(guān)遺傳多樣性參數(shù)最低,這表明在白洋淀野生群體內(nèi)部的遺傳多樣性貧乏。3個(gè)群體內(nèi)與群體間的平均遺傳距離為0.00328,群體間的遺傳距離在0.001-

4、0.005之間,遺傳距離較小,顯示3個(gè)野生群體間親緣關(guān)系較近。通過AMOVA分析,3個(gè)烏鱧野生群體的變異百分比:群體間的變異為31.91％,種內(nèi)個(gè)體間的變異為68.09%,說明3個(gè)烏鱧群體絕大部分遺傳變異發(fā)生在種內(nèi),并不是群體間。從系統(tǒng)發(fā)育來看,單倍型之間并沒有按照單倍型所屬群體的分類聚簇,系統(tǒng)發(fā)育樹的端部分枝支持度相對較低,表現(xiàn)為不同群體個(gè)體相互交錯(cuò)形成復(fù)雜的簇群,其主要原因是分枝內(nèi)部核苷酸分歧水平相對較低造成的,證明了烏鱧3個(gè)群體間