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文檔簡介
1、大豆產(chǎn)量相關(guān)性狀粒形及百粒重與大豆產(chǎn)量和品質(zhì)緊密相關(guān),其遺傳機制的分析具有重要的應(yīng)用價值。以往的研究多采用雙親分離群體,得到的結(jié)果受限于兩親本范圍內(nèi),不能充分挖掘最優(yōu)等位變異。本研究以大豆品種自然群體為材料,采用關(guān)聯(lián)分析方法檢測粒形性狀及百粒重的相關(guān)標(biāo)記,并對其進(jìn)行等位變異解析,挖掘優(yōu)異等位變異,選配優(yōu)異親本組合,為大豆產(chǎn)量改良分子設(shè)計育種奠定堅實的基礎(chǔ)。
本研究選取分布于我國六大栽培生態(tài)區(qū)的215份大豆地方品種,于南京農(nóng)
2、業(yè)大學(xué)江浦試驗站考察粒長、粒寬、粒高、長/寬、寬/高、長/高及百粒重等7個產(chǎn)量相關(guān)性狀,并通過分子生物學(xué)實驗技術(shù)用135個SSR標(biāo)記對該群體進(jìn)行全基因組掃描,獲得7組數(shù)量性狀表型數(shù)據(jù)和1組分子標(biāo)記數(shù)據(jù)。
首先,利用分子標(biāo)記信息刻劃群體的遺傳特征,包括用STRUCTURE2.2軟件分析該群體的遺傳結(jié)構(gòu)、PowerMarker3.0軟件分析群體的遺傳多樣性和TASSEL軟件分析分子標(biāo)記間的連鎖不平衡(Linkage Diseq
3、uilibrium,LD)。結(jié)果表明:1)該定位群體包含5個亞群,當(dāng)每品種分到各亞群概率的臨界值設(shè)為0.4時,73.5%的大豆品種被明確分到四個亞群中,剩余品種組成混合組;2)135個SSR標(biāo)記共產(chǎn)生了890個等位變異,變幅為1~26,多態(tài)性信息含量PIC(Sat_228的PIC為0)的變幅為0.02~0.94;3)在134個多態(tài)性SSR標(biāo)記產(chǎn)生的8911對位點對中,2004(22.49%)對位點對存在LD(P〈0.05),其中共線性位
4、點對比例(34.16%)明顯高于非共線性位點對比例(21.88%),上述總體結(jié)果明顯高于各亞群內(nèi)的結(jié)果。
其次,利用分子標(biāo)記與數(shù)量性狀表型信息,進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,定位各性狀的主效QTL和上位性QTL.1)運用經(jīng)驗貝葉斯方法檢測到與大豆粒形及百粒重相關(guān)的主效位點(次)31個(LOD≥2.5,P〈0.05),分別為粒長2個,粒寬4個,粒高6個,長/寬1個,寬/高7個,長/高5個,百粒重6個,其中5個位點同時與多個性狀相關(guān);上位性位
5、點30對,其中百粒重為29對,粒長為1對,效應(yīng)均為極顯著水平。2)利用TASSEL軟件定位到相關(guān)位點(次)168個(P〈0.05),分別為粒長26個,粒寬32個,粒高28個,長/寬18個,寬/高22個,長/高17個,百粒重25個,其中86%的位點同時與多個性狀相關(guān);以百粒重為例,對該結(jié)果進(jìn)一步剖分為①與連鎖分析、經(jīng)驗貝葉斯檢測結(jié)果一致的主效QTL共10個(40%),②與經(jīng)驗貝葉斯檢測的互作QTL相一致共9個(36%),③LD引起的假Q(mào)T
6、L共6個(24%)。兩種方法檢測的結(jié)果既有一致性,又有互補性。一些標(biāo)記同時與2個或多個性狀相關(guān),可能是性狀相關(guān)乃至一因多效的遺傳基礎(chǔ)。
最后,根據(jù)經(jīng)驗貝葉斯方法檢測的QTL結(jié)果,發(fā)掘優(yōu)異等位變異和預(yù)測優(yōu)異親本組合。發(fā)掘了對粒長、粒寬、粒高、長/寬、寬/高、長/高和百粒重性狀增效潛力明顯的Sat_365-26(+2.67)、Sat一365-19(+1.19)、Sat_252-14(+0.78)、Sat_372-10(+0.1
7、7)、Satt632-8(+0.66)、Sat_372-10(+0.48)和Sat_256-12(+12.50)等位變異,典型載體材料分別為嘉祥牛毛黃、鄭州76065-3、牛毛黃、劍閣城關(guān)八月黃、雙流六月黃、穗選黃、老鼠皮。預(yù)測了改良上述性狀的可能優(yōu)異親本組合分別為:雅畈早豆×合肥兩塘焦雙青豆、鴨蛋青×雅畈早豆、湖南牛毛黃×北京豆、快豆黃×山東小粒青、溧陽大烏黃豆×合肥兩塘焦雙青豆、快豆黃×油葫蘆和大青豆×尉青豆等,其中雅畈早豆、合肥兩
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