利用形態(tài)學(xué)和SSR標(biāo)記建立柿核心種質(zhì).pdf

1、我國是柿(Diospyros kaki Thunb.)的原產(chǎn)中心之一,已有2000多年的栽培歷史,自然變異和人工選擇產(chǎn)生了大量的種質(zhì)資源。國家果樹種質(zhì)柿圃活體保存(in vivo)有571余份柿種質(zhì)。柿作為一種以營養(yǎng)繁殖為主的多年生木本果樹,不能用種子保存,而組培苗長期繼代后易發(fā)生遺傳變異。核心種質(zhì)份數(shù)少而保留了原有種質(zhì)群體的大部分遺傳多樣性,因此建立核心種質(zhì)能有效保存作物種質(zhì),但迄今尚未建立原產(chǎn)我國的柿核心種質(zhì)。而且,由于生產(chǎn)上少數(shù)品

2、種的大面積推廣,造成了許多地方品種和農(nóng)家品種被淘汰的現(xiàn)象越來越普遍,使柿品種的遺傳一致度提高。此外,在國家果樹種質(zhì)柿圃中,同物異名和同名異物現(xiàn)象比較普遍。因此,本文首先基于兩種來源的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和形態(tài)性狀構(gòu)建初選核心樣品,進而通過SSR數(shù)據(jù)和兩種數(shù)學(xué)模型構(gòu)建核心種質(zhì),以期為我國柿的種質(zhì)鑒定、評價及利用提供科學(xué)依據(jù)。
　　 主要研究結(jié)果如下:
　　 1、以《中國果樹志·柿卷》記載的558份柿種質(zhì)為試材,根據(jù)柿的脫澀類型及其地理

3、分布分組,在組內(nèi)采用類平均法對19個形態(tài)性狀進行逐步聚類,篩選出180份作為柿初選核心樣品,占原種質(zhì)收集品數(shù)目的32.3％。與原種質(zhì)收集品的遺傳多樣性比較結(jié)果表明柿初選核心樣品能夠代表原種質(zhì)收集品的遺傳多樣性。
　　 2、以CGRIS記載的294份柿為試材,設(shè)置10％、30％、50％、70％4種總體取樣比例,結(jié)合重心法、離差平方和法、類平均法3種聚類方法共建立了12個不同的柿初選核心樣品。15個形態(tài)性狀數(shù)據(jù)的均值差異百分率、方差

4、差異百分率、變異系數(shù)變化率和極差符合率比較結(jié)果表明采用總體取樣比例為30％,類平均法逐步聚類建立的柿初選核心樣品是最適宜的。初選核心樣品的數(shù)目為92份,其均值、方差、變異系數(shù)、極差和Shannon多樣性指數(shù)與294份柿種質(zhì)的比較結(jié)果表明初選核心樣品能夠很好地代表294份CGRIS柿的遺傳多樣性。
　　 3、將用《中國果樹志·柿卷》的數(shù)據(jù)得到的初選核心樣品和用CGRIS的數(shù)據(jù)得到的初選核心樣品結(jié)合,鑒定并剔除了部分同物異名的種質(zhì),

5、最終確定柿初選核心樣品為117份。
　　 4、從24對SSR引物中篩選出11對具有多態(tài)性的、能產(chǎn)生清晰譜帶的SSR引物,對117份柿初選核心樣品進行分析,用3種基于等位基因豐度最大化的方法(Mstrat軟件、PowerMarker軟件和PowerCore軟件)分別建立核心種質(zhì),通過比較發(fā)現(xiàn),用Mstrat軟件取樣11份種質(zhì)時的Nei’s基因多樣性指數(shù)、多態(tài)性位點百分率和Shannon多樣性指數(shù)表現(xiàn)優(yōu)于其它方法建立的核心種質(zhì),其遺

6、傳多樣性參數(shù)保留比例相對較高,最終核心種質(zhì)選取用Mstrat軟件取樣的11份種質(zhì)。這個核心種質(zhì)保留了與117份初選核心樣品相同的等位基因數(shù)目,能夠滿足種質(zhì)保存的需要。
　　 5、采用11對SSR引物對117份柿初選核心樣品進行分析,用2種基于遺傳距離的方法(遺傳距離取樣法和最小距離逐步取樣法)分別建立核心種質(zhì),比較發(fā)現(xiàn)用遺傳距離取樣法設(shè)置遺傳距離范圍為0.17時的核心種質(zhì)表現(xiàn)最佳。這個核心種質(zhì)的數(shù)目為15份,種質(zhì)間的最大遺傳距離

7、為0.28,與117份初選核心樣品的最大遺傳距離相同,平均遺傳距離為0.21,超過了117份初選核心樣品的平均遺傳距離(0.19),可以作為遺傳育種材料。
　　 綜上所述,利用兩種形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)記載體系-《中國果樹志·柿卷》和CGRIS分別建立了兩個柿初選核心樣品,再將兩個柿初選核心樣品結(jié)合起來獲得最終的柿初選核心樣品；在對柿初選核心樣品用SSR標(biāo)記分析的基礎(chǔ)上,分別采用等位基因數(shù)目最大化取樣策略和遺傳距離法建立了針對種質(zhì)資源保存和