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文檔簡介
1、本實驗采集東北地區(qū)5個家鴨品種,73個個體;6個地區(qū)的家鴨地方品種(采集地點包括黑龍江雙鴨山、黑龍江哈爾濱、吉林洮南、吉林白山、遼寧鐵嶺和遼寧本溪)113個個體;8種野鴨(包括斑嘴鴨、綠頭鴨、針尾鴨、赤頸鴨、赤膀鴨、鳳頭潛鴨、紅頭潛鴨和鵲鴨)53個個體;總計239個個體的組織或血液樣本。通過采集鴨的組織和血液樣本提取基因組DNA,測定鴨線粒體DNAD-loop區(qū)部分序列來研究東北地區(qū)家鴨和野鴨的遺傳多樣性與系統(tǒng)進化關(guān)系。本實驗采用鴨線粒
2、體DNAD-loop區(qū)約610bp片段進行分析。
家鴨的分析結(jié)果表明,A、C、G、T這4種核苷酸的平均比例分別為24.6%、16.3%、34.2%和24.9%。共發(fā)現(xiàn)40個變異位點(包括綠頭鴨和斑嘴鴨),約占分析位點總數(shù)的6.6%,插入/缺失位點3個;共確定29種單倍型,11種為共享單倍型;4個家鴨養(yǎng)殖品種和6個地區(qū)家鴨單倍型多樣度從0.284至0.784,單倍型變異度總體為0.571±0.097,整體的平均核苷酸差異數(shù)為
3、1.1561,核苷酸多樣度為0.1898%。家鴨群體間核苷酸分析度(Dxy)在0.041%~0.508%之間變化,核苷酸凈遺傳距離(Da)為0~0.163%之間。結(jié)果顯示,4個家鴨養(yǎng)殖品種和6個地區(qū)家鴨表現(xiàn)出較低水平的遺傳多樣性,遺傳分化不顯著。遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析表明,綠頭鴨和斑嘴鴨在東北地區(qū)家鴨起源進化過程中均有貢獻。
8種野鴨的分析結(jié)果表明,A、C、G、T這4種核苷酸的平均比例分別為25.1%、16.8%、33.
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