黃河流域黃鱔遺傳多樣性的ISSR分析.pdf

1、黃鱔(Monopterus albus Zuiew)是我國重要名優(yōu)淡水魚類，具有重要的食用和藥用價值，了解黃鱔的遺傳多樣性水平、遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳分化程度，對其種質(zhì)資源評價、保護和合理利用具有重要理論指導(dǎo)意義。本研究利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)，對黃河流域5個黃鱔自然群體(甘肅、內(nèi)蒙古、陜西、河南和山東群體)的遺傳多樣性進行分析，主要結(jié)果如下： (1)利用正交試驗方法，經(jīng)條件優(yōu)化，建立了黃鱔ISSR-PCR最佳反應(yīng)體系，25μl反應(yīng)體系

2、中含2.5 mmol/L Mg2+，0.2mmol/L dNTPs，0.4μmol/L引物，0.75 U TaqDNA聚合酶，30 ng DNA模板。并確立了PCR的最佳擴增程序：94℃預(yù)變性5 min；94℃變性40 s，48～58℃(隨引物不同而確定)復(fù)性40 s，72℃延伸1.5 min，循環(huán)次數(shù)40；72℃延伸10 min。 (2)篩選出15個引物，對黃河流域5個群體共150尾黃鱔基因組DNA進行ISSR-PCR擴增，共

3、檢測到113個位點，多態(tài)位點44個，多態(tài)性比例為38.94％。利用POPGENE軟件分析5個黃鱔群體的多態(tài)位點比例(PPB)、觀測等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei’s基因多樣度(h)、Shannon's信息指數(shù)(I)和遺傳距離(D)分別在18.58‰～23.01％、1.1858～1.2301、1.0975～1.1348、0.0625～0.0795、0.0944～0.1201、0.0696～0.0842之間，各群體所有遺

4、傳多樣性指標(biāo)綜合顯示，黃河流域黃鱔遺傳多樣性保持在一定水平，5個群體的遺傳多樣性水平依次為：陜西>甘肅>內(nèi)蒙古>山東>河南。 (3)利用Shannon's信息指數(shù)分析變異來源有49.79％存在于群體間，50.21％的變異發(fā)生在群體內(nèi)。AMOVA分析黃鱔遺傳變異來源有44.90％存在于群體間，55.10％變異發(fā)生在群體內(nèi)，顯著性檢驗顯示黃鱔群體間和群體內(nèi)均有極顯著的遺傳分化(P<0.001)：兩種方法的研究結(jié)果均表明黃河流域黃鱔的

5、分化在群體內(nèi)和群體間的分布基本一致，都存在較大的遺傳分化。AMOVA分析顯示黃鱔群體間的遺傳分化系數(shù)φst為0.4490，利用POPGENE基于Nei’s基因多樣性計算黃鱔群體間遺傳分化系數(shù)Gst為0.5422，兩種結(jié)果都說明黃鱔群體間存在強烈的遺傳分化。由Gst計算的種群間基因流(Nm)為0.4222，基因流水平較低。 (4)根據(jù)Nei的公式計算群體間的無偏遺傳距離(D)，結(jié)果顯示，內(nèi)蒙古群體與山東群體遺傳距離最大(0.177