番茄保守性microRNA對(duì)病毒侵染的響應(yīng).pdf

1、MicroRNA.(miRNAs)是一類廣泛存在于動(dòng)植物中高度保守的非編碼的小分子RNA。通過(guò)在番茄核酸數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索其他植物的已知miRNA，發(fā)現(xiàn)了13條保守的pre-nuRNA對(duì)應(yīng)9條成熟miRNAs，其中6條已經(jīng)被克隆到。為了驗(yàn)證預(yù)測(cè)結(jié)果，利用已知植物非冗余的成熟miRNA互補(bǔ)序列做為探針制作了miRNA檢測(cè)芯片。與抽提至番茄葉組織的小RNA雜交后發(fā)現(xiàn)，包含上述預(yù)測(cè)的miRNA在內(nèi)的78條成熟miRNA被檢測(cè)到。Northern雜交

2、結(jié)果顯示預(yù)測(cè)得到的miRNA在番茄葉組織、根和莖中均高度累積。用新發(fā)現(xiàn)的番茄保守性miRNA檢測(cè)來(lái)自NCBI的番茄mRNA后發(fā)現(xiàn)23條潛在的靶基因，主要與番茄營(yíng)養(yǎng)期向生殖期的轉(zhuǎn)變，花的發(fā)育和對(duì)生長(zhǎng)素和病毒脅迫的響應(yīng)有關(guān)。
　　 植物病毒已經(jīng)進(jìn)化出自身的策略對(duì)抗寄主的RNA沉默，而在作用過(guò)程中寄主的miRNA表達(dá)被顯著的改變。本研究廣泛的調(diào)查了各種代表性病毒CMV-Fny、CMV-Fny△2.(2b基因被敲出)、CMV-FnyYn

3、12、CMV-FnyT1和ToMV-N5侵染后，對(duì)番茄葉組織中miRNA表達(dá)的影響。結(jié)果顯示CM.2b蛋白作為沉默抑制子顯著地改變了miRNAs的表達(dá)圖譜，推測(cè)88％異常表達(dá)是由2b蛋白引起的。結(jié)果顯示CMV不同衛(wèi)星RNA侵染番茄后產(chǎn)生不同的表達(dá)圖譜，顯示番茄miRNA表達(dá)可能具有不同抗病毒侵染的方式。與ToMV-N5侵染后相比，所有的CMV-Fny侵染引起的差異miRNAs下調(diào)，ToMV-N5侵染引起差異miRNAs表達(dá)上調(diào)，暗示To