溆浦白鵝PRL基因編碼區(qū)序列遺傳變異及相關(guān)分析.pdf_第1頁
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1、本研究以與就巢性狀關(guān)系密切的 PRL 基因?yàn)楹蜻x基因,通過設(shè)計(jì)的7對(duì)引物對(duì)溆浦白鵝PRL基因編碼區(qū)序列進(jìn)行克隆測(cè)序;運(yùn)用PCR-SSCP手段分別對(duì)7對(duì)引物所得片段進(jìn)行多態(tài)性分析;探尋 PRL 基因編碼區(qū)序列與產(chǎn)蛋量性狀的相關(guān)程度,并檢測(cè)基因突變位點(diǎn)。 PCR-SSCP分析結(jié)果表明,試驗(yàn)群體PRL基因第1、2、3、5外顯子在所檢測(cè)位點(diǎn)上不存在SNP,所檢測(cè)到的等位基因在群體中已固定。在外顯子4中發(fā)現(xiàn)一處SNP位點(diǎn)G/A,分析結(jié)果表

2、明未引起氨基酸序列改變,為沉默突變。野生型等位基因(A)頻率為0.8837,突變型等位基因(B)頻率為0.1163;群體中檢測(cè)到兩種基因型,AA基因型頻率為0.7647,BB基因型頻率為0,AB基因型頻率為0.2326。在內(nèi)含子2中發(fā)現(xiàn)的SNP位點(diǎn)為T/C突變,并得到了兩個(gè)基因型,其中C基因頻率為0.907,D的基因頻率為0.093;CC基因型頻率為0.814,CD基因型頻率為0.186,DD基因型頻率為 0。對(duì)試驗(yàn)群體中這兩個(gè)SNF位

3、點(diǎn)分別進(jìn)行卡方檢驗(yàn),結(jié)果表明其基因型分布與理論比例差異不顯著(P>0.05),均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。經(jīng)SPSS軟件對(duì)PRL基因SNP與溆浦白鵝產(chǎn)蛋量性狀的相關(guān)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果表明不同基因型對(duì)產(chǎn)蛋量性狀影響不顯著(P<0.05)。 將溆浦白鵝PRL基因編碼區(qū)序列與其他禽類比較,其中溆浦白鵝與皖西白鵝、農(nóng)安籽鵝、萊茵鵝和馬崗鵝等同源性分別為99.7%、99.7%、99.6%、98.8%;與北京鴨同源性為98.

4、4%;與家雞同源性為92.0%。 經(jīng)氨基酸序列分析表明,溆浦白鵝與皖西白鵝、萊茵鵝分別在第69位的氨基酸(L/F)和第56位氨基酸(H/R)有變化,但親水性、極性以及電荷都沒有發(fā)生變化,只是分子量略有變化,此變化在第1個(gè)a螺旋位置;與馬崗鵝比較有三個(gè)氨基酸突變位點(diǎn),首先在第6位氨基酸有個(gè)A/D的突變,其在信號(hào)肽序列上發(fā)生了氨基酸性質(zhì)上的改變,其次,在第105位氨基酸有個(gè)D/H的突變,其突變位點(diǎn)在第4個(gè)a螺旋位置,其親水性、極性以

5、及電荷都沒有發(fā)生變化,只是分子量略有變化,再者,在第205位氨基酸有個(gè)R/H的突變。這些突變對(duì)于PRL保守的分泌和運(yùn)輸方式可能是必須的,但是是否影響其功能還有待于進(jìn)一步研究。 通過生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示溆浦白鵝PRL基因內(nèi)含子2突變位點(diǎn)T/C顛換可能導(dǎo)致此處增加了個(gè)SRY因子并可能導(dǎo)致TSt-1因子改變?yōu)镹kx-2因子。利用密碼子使用頻率庫對(duì)溆浦白鵝PRL基因外顯子4發(fā)生的G/A突變位點(diǎn)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)密碼子CUG變?yōu)镃UA,兩者

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