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1、環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(Loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技術(shù)是一種新穎的核酸擴(kuò)增技術(shù),該技術(shù)以其靈敏度高、特異性強(qiáng)、反應(yīng)速度快、檢測(cè)成本低等優(yōu)點(diǎn)已廣泛應(yīng)用于各種病原體的檢測(cè),但在環(huán)境污染監(jiān)測(cè)方面的應(yīng)用則較少。
本文以我國(guó)海洋經(jīng)濟(jì)魚類褐菖鲉(Sebastiscus marmoratus)為研究對(duì)象,克隆了四種熱休克蛋白(heat shock proteins,HSPs)——HS
2、P60、HSC70、HSP70和HSP90基因序列,分別建立并優(yōu)化定量LAMP技術(shù)。為驗(yàn)證定量LAMP技術(shù)的可行性,將褐菖鲉分別暴露于20μg·L-1、60μg·L-1和180μg·L-1原油水溶性成分(water soluble fraction,WSF),第1、5、10d采樣,利用定量LAMP技術(shù)檢測(cè)肝HSPs基因的表達(dá)情況,并與Real-time PCR結(jié)果進(jìn)行比較。
主要研究結(jié)果如下:
(1)建立了H
3、SPs的LAMP檢測(cè)方法,并對(duì)其中的幾個(gè)重要參數(shù)進(jìn)行了優(yōu)化。結(jié)果表明,Mg2+最佳濃度為8 mmol·L-1,外引物與內(nèi)引物濃度比為1:6時(shí)效果最好,最適反應(yīng)溫度為64℃,最佳反應(yīng)時(shí)間為50 min,甜菜堿最佳濃度為0.4mol·L-1,dNTP最佳濃度為1.4 mmol·L-1。
(2)本實(shí)驗(yàn)以HNB為染料,建立了定量LAMP檢測(cè)技術(shù),對(duì)其靈敏度進(jìn)行摸索發(fā)現(xiàn),檢測(cè)限為4.74×104 copies,而Real-time
4、PCR的檢測(cè)限為2.75 copies。雖然LAMP的靈敏度低于Real-time PCR,但是LAMP反應(yīng)快,成本低,耗時(shí)短,只需簡(jiǎn)易的實(shí)驗(yàn)設(shè)備,更適用于現(xiàn)場(chǎng)的快速檢測(cè)。
(3)原油WSF短期毒性實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,LAMP的檢測(cè)結(jié)果與Real-time PCR的基本一致,表明該方法可用于實(shí)際樣品的快速檢測(cè);不同濃度原油WSF暴露下,不同HSPs基因mRNA的表達(dá)變化趨勢(shì)不一致,其中對(duì)WSF敏感性和特異性較好的是HSP60和H
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