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1、第十五章 常用醫(yī)學統(tǒng)計軟件簡介,預(yù)防醫(yī)學,,第一節(jié) EpiData 3.02軟件簡介,一、EpiData的基礎(chǔ)知識,EpiData由三種基本文件組成:QES文件 (調(diào)查表文件),它的作用是定義調(diào)查表(問卷)的結(jié)構(gòu)。REC文件 (數(shù)據(jù)文件),它包括數(shù)據(jù)以及已經(jīng)定義好的編碼。CHK文件 (數(shù)據(jù)錄入核查文件),數(shù)據(jù)輸入字段的有效性規(guī)則。字段:每個字段就是我們臨床觀察表中的一個小項目。它包括:1.字段的名稱;2.字段的文本描述
2、;3.字段的數(shù)據(jù)變量。,二、EpiData運行界面介紹,運行EpiData.exe會出現(xiàn)程序運行界面(圖15-1)圖15-1 EpiData3.02軟件主界面,二、EpiData運行界面介紹,第一行:EpiData菜單欄 1.文件;2.數(shù)據(jù)核對;3.數(shù)據(jù)輸入/輸出;4.其他功能; 5.工具; 6.窗口設(shè)置; 7.幫助。 第二行:EpiData工作過程工具欄 1.建立調(diào)查表文件;2.生成
3、數(shù)據(jù)文件; 3.添加核對命令;4.數(shù)據(jù)錄入; 5.其他功能;6.數(shù)據(jù)輸出。第三行:EpiData常用的幾個快捷工具按鈕,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-2 需要建立數(shù)據(jù)庫的原調(diào)查表示意圖,1.打開原始的調(diào)查表(見圖15-2)。,(一)建立調(diào)查表文件點擊“建立調(diào)查表文件”按鈕,選擇“建立新調(diào)查表文件”。,圖15-3 選擇字段類型,2.根據(jù)原始表格在EpiData輸入相關(guān)內(nèi)容。在“姓名”之后,點
4、擊“選擇字段類型”按鈕,在選項卡片之中選擇“文本”,設(shè)置為文本,長度8個字節(jié)(注意一個漢字的長度需要2個字節(jié)),點擊“插入”按鈕(圖15-3)。,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-4 產(chǎn)生qes調(diào)查表,3.依此類推將其他觀察指標進行輸入并保存(圖15-4)。,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-5 輸入數(shù)據(jù)庫電子表,4.點擊數(shù)據(jù)表預(yù)覽按鈕(圖15-5)。,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-6
5、 腦血管病人血脂調(diào)查表.REC,(二)建立數(shù)據(jù)文件建立.REC文件。點擊“生成數(shù)據(jù)文件”按鈕,選擇“生成數(shù)據(jù)文件”, 生成 “腦血管病人血脂調(diào)查表.REC”文件(圖15-6)。,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-7 自動提醒自動保存數(shù)據(jù)庫對話框,點擊“輸入數(shù)據(jù)”按鈕,打開“腦血管病人血脂調(diào)查表.REC”文件,將數(shù)據(jù)輸入表格,錄入完整后,軟件會自動提醒進行保存(圖15-7),確認保存之后就可以輸入下一張表格的數(shù)
6、據(jù)了。,(三)數(shù)據(jù)錄入,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-8 輸出的文本類型數(shù)據(jù)庫,點擊“數(shù)據(jù)輸出”按鈕,選擇“腦血管病人血脂調(diào)查表.REC”文件。,(四)數(shù)據(jù)輸出,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-9 輸出的Excel數(shù)據(jù)庫,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,Epidata提供了對字段的進一步設(shè)置功能。點擊工作過程工具條中“添加核對命令”按鈕,仍舊選擇“腦血管病人血脂調(diào)查表.REC”這個數(shù)據(jù)文件
7、,同樣會出現(xiàn)我們作好的電子表格,這時軟件也會自動生成同名的.CHK文件,同時會有一個數(shù)據(jù)核對窗口(如圖15-10)。,(五)優(yōu)化數(shù)據(jù)表,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-10 數(shù)據(jù)核對數(shù)據(jù)庫窗口,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-11 邏輯值設(shè)置窗口,1.Rang,Legal:是定義一個字段的數(shù)字范圍及合理數(shù)。例如,我們對“年齡”字段進行設(shè)置,輸入“50-85”( 圖15-11)。,三、使用EpiDat
8、a建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,Jump:跳轉(zhuǎn)命令。Must enter:如果當前字段必須輸入數(shù)據(jù),則需要使用這個規(guī)則,選擇Yes。Epidata的默認選擇為No。Repeat:如果在編輯表中Repeat選擇項中選擇“Yes”則前一個記錄中的該字段值將自動出現(xiàn)在下一個記錄的該字段中。Value label:是將一組具有解釋數(shù)值意義的文本與數(shù)值結(jié)合。,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-13 編輯數(shù)據(jù)標簽窗口,例如,我們對“職業(yè)
9、”這個字段進行設(shè)置(圖15-13)。,圖15-14 選擇數(shù)值窗口,當錄入職業(yè)時,按F9鍵,這時會彈出一張轉(zhuǎn)換表,如下(圖15-14)。,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,圖15-15 數(shù)據(jù)核查結(jié)果,為了保證數(shù)據(jù)錄入的可靠性,我們可以讓兩個人分別輸入同樣的一組調(diào)查表數(shù)據(jù),Epidata提供了對兩個相同數(shù)據(jù)文件的檢查功能。,三、使用EpiData建立臨床數(shù)據(jù)錄入表,(六)如何核查數(shù)據(jù)文件,第二節(jié) SPSS10.01社會醫(yī)學
10、統(tǒng)計軟件包,一、SPSS10.01主要的功能窗口,SPSS10.01主要有3大窗口:,數(shù)據(jù)編輯窗口(Data Editor)結(jié)果輸出窗口(Viewer)語句編輯窗口(Syntax Editor),一、SPSS10.01主要的功能窗口,圖15-16 SPSS主界面窗口,整個數(shù)據(jù)編輯窗口分為標題欄、菜單欄、工具欄、編輯欄、內(nèi)容區(qū)和狀態(tài)欄。SPSS程序很大,命令和功能也很多,我們主要介紹菜單欄上的10個菜單命令。(見圖15-16
11、),(一)SPSS數(shù)據(jù)編輯窗口,一、SPSS10.01主要的功能窗口,SPSS輸出窗口是用于展示SPSS的統(tǒng)計分析結(jié)果。其菜單命令與數(shù)據(jù)編輯窗口相似,只是減少了幾個菜單項,而另加了一個Insert菜單項,在圖形編輯窗口中,可以作圖形轉(zhuǎn)換,可存為.spo為后綴的文件。,(二) SPSS輸出窗口,一、SPSS10.01主要的功能窗口,在語句編輯窗口,SPSS過程以命令語句形式出現(xiàn)。該窗口還可以編輯對話框操作不能實現(xiàn)的特殊過程的命令語句。窗口
12、中所有的命令語句最終形成一個命令語句文件,可存為.sps為后綴的文件。,(三) SPSS語句編輯窗口,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,1.統(tǒng)計描述:Analyze → Descriptive Statistics →FrequenciesDescriptivesExploreAnalyze → Compare Means → Means 這里只簡單介紹Frequencies過程和Descriptives過程。,(一)數(shù)值
13、變量資料的統(tǒng)計分析,圖15-17 描述統(tǒng)計量結(jié)果,1)結(jié)果如下:,(1)頻數(shù)分析(Frequencies),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-18 直方圖,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,2)對資料進行分組:Transform → Recode → Into same Variables3)對已分組資料進行頻數(shù)分析步驟: 輸入各組組中值x和頻數(shù)f;對變量值進行加權(quán),進行Weight cases過程;進行Fre
14、quency過程,此步同原始數(shù)據(jù)資料的操作。,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,Descriptives對話框(圖15-19) Options對話框(圖15-20),(2)描述統(tǒng)計(Descriptives),圖15-21 描述性統(tǒng)計量顯示,結(jié)果如下:顯示描述統(tǒng)計量(見圖15-21)。,(2)描述統(tǒng)計(Descriptives),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,Analyz
15、e → Compare Means → One-samples T Test Independent-samples T Test Paired-samples T Test
16、 One-way ANOVA Analyze → General Linear Model → Univariate,2.統(tǒng)計推斷,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,例:有83例患者的血小板資料,問患者的血小板與正常人的平均值150(109/L)有無統(tǒng)計學意義,同時估計患者血小板的可信區(qū)間。步驟:1)Analyze → Compare Means → One-samples
17、T Test,打開對話框;2)把變量血小板轉(zhuǎn)到右邊的“Test Variables”欄中(見圖15-22、15-23);,(1)單樣本t檢驗(One-Samples T Test),2.統(tǒng)計推斷,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,t檢驗對話框(圖15-22) Options對話框(圖15-23),圖15-24 單樣本t檢驗結(jié)果,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)
18、果解釋,例如有一個189例患者的臨床資料,問不同性別之間的收縮壓(bp1)、舒張壓(bp2)分別是否相同? 步驟:1)Analyze → Compare Means → Independent-samples T Test;把變量bp1、bp2轉(zhuǎn)到 “Test Variables”欄中;2)把變量sex轉(zhuǎn)到 “Grouping Variable”欄中,激活“Define Groups”對話框,定義兩組的兩個值,然后單擊ok按鈕
19、,返回;(見圖15-27 ),2.統(tǒng)計推斷(2)成組設(shè)計兩樣本t檢驗(Independent-samples T Test),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-27 兩獨立樣本t檢驗對話框,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-28 兩獨立樣本t檢驗描述性統(tǒng)計量,3)檢驗;單擊“OK”按鈕即可。結(jié)果如下:,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-29 兩獨立樣本t檢驗結(jié)果,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及
20、結(jié)果解釋,結(jié)果顯示:收縮壓和舒張壓的方差齊性檢驗的F值分別為0.092和1.118,說明方差齊,收縮壓P=0.015<0.05,不同性別間差異有顯著性;但不同性別的舒張壓差異無顯著性,P=0.057>0.05。,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,例如有20名患者,按性別和年齡配成10對,隨機分到兩組,一組服用新藥,另一組服用安慰劑,然后觀察某實驗指標,問新藥和安慰劑的療效有無差別?,2.統(tǒng)計推斷 (3)配對t檢驗(Paired-
21、samples T Test),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-30 配對比較t檢驗,分析步驟如下:Analyze → Compare Means →Paired-samples T Test,打開對話框;從左側(cè)同時選中兩個成對變量,轉(zhuǎn)到 “Paired Variables”欄中;t檢驗對話框結(jié)果類似單樣本t檢驗,P=0.158>0.05,尚不能說明新藥和安慰劑的療效不同。結(jié)果見圖15-30。,二、主要統(tǒng)計方法的軟
22、件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,例如有一個189例患者的臨床資料,問不同意識程度之間的收縮壓(bp1)、舒張壓(bp2)分別是否相同?分析步驟如下:Analyze → Compare Means →One-way ANOVA,打開對話框;把變量bp1、bp2轉(zhuǎn)到 “Dependent List”欄;,2.統(tǒng)計推斷 (4)單因素方差分析(One-way ANOVA),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,,把變量意識程度轉(zhuǎn)到 “Factor”
23、欄中;單擊“Contrasts”按鈕,激活對話框,選擇“Polynomial”,單擊“Continue”按鈕返回;單擊“Post Hoc”按鈕,激活對話框,若方差齊時選擇Bonferroni兩兩比較方法,方差不齊時選擇Tamhane’s T2方法,單擊“Continue”按鈕返回;單擊“Options”按鈕,激活對話框,選擇Descriptive和Homogeneity-of-variance選項,單擊“Continue”按鈕返回
24、;單擊“OK”即可。(具體見圖15-31、15-32、15-33),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,,圖 15-31 單因素方差分析對話框 圖15-32 Contrasts對話框,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,結(jié)果如下:包括各組變量值的描述統(tǒng)計(圖15-34);方差齊性檢驗(圖15-35);從方差分析表中可知,不同意識程度之間的收縮壓、舒張壓相等,P分別為0.922、0.108,均>0.05;
25、兩兩比較表省略。,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-34 一般描述性統(tǒng)計量,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-35 方差齊性檢驗結(jié)果,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,例如16只家兔按種屬分成4個區(qū)組,每個區(qū)組中的4只家兔分別在不同室溫下(5、10、15、20度)測血糖濃度,問不同室溫下家兔的血糖濃度是否相同?步驟:Analyze → General Linear Model → Univariate
26、,打開對話框;從左側(cè)選中變量“血糖濃度”轉(zhuǎn)到“Dependent Variable”欄中,處理因素選入“Fixed Factor”欄中,區(qū)組因素選入“Random Factor”欄中;單擊“OK”即可。見圖15-36,2.統(tǒng)計推斷(5)隨機區(qū)組設(shè)計的方差分析,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-36 Univariate對話框,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-37(雙因素設(shè)計方差分析結(jié)果),結(jié)果表明不同室溫
27、下家兔的血糖濃度不相同。,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,,1.統(tǒng)計描述:Analyze → Descriptive Statistics →Frequencies Crosstables 頻數(shù)分析(Frequencies)可產(chǎn)生頻數(shù)表,計算構(gòu)成比;也可以繪出條圖或圓圖。,(二)分類資料的統(tǒng)計分析,二、主要
28、統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,,例:有一組臨床病人的資料,觀察性別和意識程度情況。步驟:(1)Analyze → Descriptive Statistics →Frequencies,打開對話框;(2)從左側(cè)選中性別和意識程度兩變量,轉(zhuǎn)到“Variables”欄中;(3)單擊“Charts”按鈕,打開對話框,選中Bar Charts或Pie Charts選項,單擊“Continue”返回后,單擊“OK”即可(見圖15-38、圖
29、15-39和圖15-40)。,(二)分類資料的統(tǒng)計分析,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-38 Frequencies對話框,(二)分類資料的統(tǒng)計分析,圖15-40 Charts對話框,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-39 format 對話框,,(二)分類資料的統(tǒng)計分析,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-41 分類資料描述統(tǒng)計量,(二)分類資料的統(tǒng)計分析,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解
30、釋,圖15-42 分類變量直條圖,(二)分類資料的統(tǒng)計分析,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,列聯(lián)表分析(Crosstables)可產(chǎn)生四格表、R×C表,計算率或構(gòu)成比;同時進行χ2檢驗。 χ2檢驗在SPSS中的過程:,(二)分類資料的統(tǒng)計分析,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-43 分類頻數(shù)表資料數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu),在數(shù)據(jù)編輯窗口中確定行變量、列變量、頻數(shù)變量(圖15-43);,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及
31、結(jié)果解釋,必須指定頻數(shù)變量,Data →Weight Cases,前面已闡述過;Analyze → Descriptive Statistics →Crosstables,打開對話框,把行變量和列變量分別從左側(cè)轉(zhuǎn)到右側(cè)的Rows和Columns欄中;單擊“Statistics”按鈕,激活對話框,根據(jù)不同資料、不同的研究目的,在對話框中選入不同的分析指標,然后單擊“Continue”返回后,單擊“OK”即可。,(二)分類資料的統(tǒng)計分析
32、,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-44 卡方檢驗主要對話框,如何在Statistics對話框中選入不同的分析指標(圖15-44):,(二)分類資料的統(tǒng)計分析,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,下面結(jié)果里χ2=26.066,P=0.000,表明不同喂養(yǎng)方式的嬰兒腹瀉發(fā)生率不同。具體結(jié)果見圖15-45,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-45 卡方檢驗結(jié)果,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,Analyze菜單
33、→ Nonparametric Tests ↓Two-Independent-Samples TestsTests for Several Independent SamplesTwo-Related-Samples TestsTests for Several Related Samples,(三)非參數(shù)檢驗,二、主要統(tǒng)計方法
34、的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,1.成組設(shè)計兩樣本均數(shù)比較的非參數(shù)檢驗(Two-Independent-Samples Tests)如比較兩種手術(shù)方案患者的生存日數(shù)間的比較,假設(shè)生存日數(shù)呈偏態(tài)分布。在“Test type”復(fù)選框組中選中最常用的“Mann-Whitney U”復(fù)選框(圖15-46)。,(三)非參數(shù)檢驗,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-46 成組比較秩和檢驗對話框,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-47
35、 兩組比較秩和檢驗結(jié)果,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,2.配對設(shè)計兩樣本均數(shù)比較的非參數(shù)檢驗(Two-Related-Samples Tests)在“Test type”復(fù)選框組中選中最常用的“Wilcoxon”復(fù)選框,即配對設(shè)計兩樣本均數(shù)比較的秩和檢驗。 結(jié)果如下:Wilcoxon Signed Ranks Test(圖15-48)結(jié)果中P=0.154,說明兩種方法相同。,(三)非參數(shù)檢驗,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果
36、解釋,圖15-48 配對設(shè)計秩和檢驗結(jié)果,(三)非參數(shù)檢驗2.配對設(shè)計兩樣本均數(shù)比較的非參數(shù)檢驗,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,3.成組設(shè)計多樣本均數(shù)比較的非參數(shù)檢驗(Tests for Several Independent Samples)和區(qū)組設(shè)計多樣本均數(shù)比較的非參數(shù)檢驗(Tests for Several Related Samples)它們的基本對話框分別如下,與方差分析中不同的是:它們不提供多重比較。(主要對話
37、框見圖15-49、15-50),(三)非參數(shù)檢驗,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-49 成組設(shè)計多樣本秩和檢驗圖 15-50 隨機區(qū)組設(shè)計多樣本秩和檢驗,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-51 完全隨機設(shè)計秩和檢驗主要結(jié)果,NPar Tests 主要結(jié)果見圖15-51Kruskal-Wallis Test,二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,Analyze → Correlate → Bivar
38、iate(雙變量相關(guān))、 Partial(偏相關(guān)分析)Analyze →Regression → Linear 例:隨機抽取10名女中學生,測得體重和肺活量情況,問女中學生的體重與肺活量之間有無直線關(guān)系?,(四)直線回歸和相關(guān),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-53 直線回歸的主要對話框,(四)直線回歸和相關(guān),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-54 回歸模型擬合指標選擇對話框,(四)直線回歸和相關(guān),二、主
39、要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-55 描述性統(tǒng)計量結(jié)果 圖15-56 模型優(yōu)劣評價指標,Regression 結(jié)果,(四)直線回歸和相關(guān),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-57兩個變量的相關(guān)分析結(jié)果,(四)直線回歸和相關(guān),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-58 回歸系數(shù)顯著性檢驗結(jié)果,(四)直線回歸和相關(guān),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,圖15-59 線性回歸分析主要結(jié)果,(四)直線回歸和相
40、關(guān),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,從結(jié)果中可知方程的決定系數(shù)、調(diào)整決定系數(shù)、剩余標準差分別等于0.482、0.418、331.19;女中學生的體重與肺活量之間有直線關(guān)系,因為對回歸系數(shù)b做t檢驗,P=0.026<0.05;直線回歸方程為:肺活量= -1375.228+91.117體重。,(四)直線回歸和相關(guān),二、主要統(tǒng)計方法的軟件實現(xiàn)及結(jié)果解釋,思考題1.建立數(shù)據(jù)庫在Epidata3.02中關(guān)鍵的步驟有哪些?應(yīng)該注意哪些問題?
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