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文檔簡介
1、質(zhì)粒的構建:1.酶切反應按照1ugDNA需110u內(nèi)切酶的用量,在反應體系中加入相應的10緩沖液,內(nèi)切酶的體積不得大于總體積的十分之一,ddH2O補足體系,如需長時間消化,還需加入適量的BSA已穩(wěn)定內(nèi)切酶活性。2.DNA片斷的回收欲回收的DNA片斷經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分離后,切下所需片斷所在的凝膠(膠的體積盡可能?。?,加入3倍體積的BufferQX1及適量的QIAXⅡ(Glassmilk)55℃10分鐘,每隔2分鐘渦旋1次,待凝膠完全溶解,
2、12000轉(zhuǎn)離心1分鐘,BufferQX1洗滌沉淀1次以消除剩余凝膠.。再用BufferB洗滌沉淀2次,將沉淀晾干,加入適當體積的ddH2O離心后收集上清,瓊脂糖凝膠電泳確定回收效率。3.DNA片斷3凹端的補平于Eppendf管中依次加入DNA0.25ug2mMdNTP2ul人以一種酶切緩沖液(10)2ul加水至19ul。然后加入15單位Klenow酶,混勻后室溫下反應15分鐘。待補平反應結(jié)束后,于65℃水浴20分鐘使Klenow酶失活
3、,電泳定量后即可用于連接反應或20℃保存?zhèn)溆谩?.DNA片斷3凸端的補平于Eppendf管中依次加入DNA0.25ug2mMdNTP2ul人以一種酶切緩沖液(10)2ul。加水至19ul。然后加入12單位T4噬菌體DNA聚合酶,12℃溫育15分鐘,于75℃加熱10分鐘,使T4噬菌體DNA聚合酶滅活。5.載體的脫磷酸化:載體質(zhì)粒經(jīng)內(nèi)切酶酶切后可直接進行脫磷酸化處理。40ul的酶切反應體系,景點永建車酶切完全后可加入10CIAP(牛小腸堿性
4、磷酸酶)緩沖液5ul水4ul和適量CIAP進行脫磷酸化反應。CIAP的用量依載體5端磷酸的摩爾數(shù)及末端性質(zhì)而定,對于5突出的末端,每100pmol5末端磷酸需1單位CIAP,對于5凹端或平末端,每2pmol5端末端磷酸需1單位CIAP一般2ug5kb的線性化質(zhì)粒DNA約翰1.4pmol5端磷酸。反應條件:1)5突出末端:加入CIAP后于37℃反應30分鐘,再加另一小份CIAP(加入量依DNA量而定),繼續(xù)反應30分鐘。2)5凹或平末端:
5、加入CIAP后于37℃反應15分鐘,56℃反應15分鐘,再加另一小份CIAP(加入量依DNA量而定),又于37℃反應15分鐘,56℃反應15分鐘。取0.1ml過夜菌液接種到含抗菌素的25mlLB培養(yǎng)基中,37℃振搖培養(yǎng)到OD600接近0.6,將25ml培養(yǎng)物轉(zhuǎn)移至含抗菌素的500mlLB培養(yǎng)基中,37℃振搖2.5小時(OD600約為0.4),加入2.5ml氯霉素溶液(34mgml)37℃振搖培養(yǎng)過夜,于4℃4000轉(zhuǎn)離心10分鐘,收集菌
6、體,用20ml含溶菌酶(5mgml)的溶液Ⅰ(25mMTrisClpH8.010mMEDTApH8.050mMSucrose)懸浮細菌,室溫靜置5分鐘,加入新鮮配置的溶液Ⅱ(0.2MNaOH1%SDS)40ml,冰上混勻變性10分鐘,加入30ml溶液Ⅲ(3MKACpH4.6)中和10分鐘。4℃12000轉(zhuǎn)離心20分鐘,轉(zhuǎn)移上清至另一管中,加入0.6倍體積的異丙醇,混勻,室溫放置30分鐘,室溫12000轉(zhuǎn)離心15分鐘,用70%乙醇洗沉淀一
7、次,室溫晾干,沉淀溶于8mlTE緩沖液中稱取8gCSCl加至DNA溶液中,加入0.6mlEB(10mgml)溶液中于20℃,45000轉(zhuǎn)離心24小時,用毛細管吸出質(zhì)粒DNA區(qū)帶。水飽和正丁醇抽提數(shù)次去除EB,用4倍體積ddH2O稀釋含CSCl的DNA溶液,再用2.5倍體積的無水乙醇沉淀DNA20℃靜置12小時,于4℃15000轉(zhuǎn)離心20分鐘,用70%乙醇沉淀一次,室溫晾干后,榮譽適量的(0.51ml)TE緩沖液中,電泳檢查DNA質(zhì)量,讀
8、取OD260與OD280,計算DNA濃度與純度。電穿孔轉(zhuǎn)染質(zhì)粒DNA1)電穿孔前一天,以合適密度傳代細胞,使細胞在轉(zhuǎn)染前處于對數(shù)生長期。2)胰酶消化收集貼壁細胞,離心收集細胞。用電轉(zhuǎn)緩沖液洗細胞兩次。電轉(zhuǎn)緩沖液為磷酸緩沖液。3)棄上清,用0.5ml電轉(zhuǎn)緩沖液重懸細胞,細胞濃度最好在21062107之間。細胞懸液移入0.4cm電轉(zhuǎn)杯中,加入540ug質(zhì)粒,輕彈混勻。置于冰上10分鐘。4)電擊。對大部分哺乳動物細胞,電壓為250400伏,即
9、6251000vcm,電容為960uF。在此條件下,電擊時間大約在3050毫伏。不同的細胞電轉(zhuǎn)的最適條件不同,細胞電擊后死亡率在40%60%左右時轉(zhuǎn)染效率最高。5)電擊結(jié)束后,將細胞置于冰上10分鐘。有文獻報道,電擊前后置于冰上10分鐘可提高轉(zhuǎn)染效率。6)電擊后,細胞移入非選擇性培養(yǎng)基培養(yǎng)。培養(yǎng)24小時后,計數(shù),稀釋15倍以上,用選擇培養(yǎng)基培養(yǎng)。24天換液,直至抗性克隆形成。如用于篩選單克隆,HeLa細胞電擊24小時后計數(shù),細胞用選擇培
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