生物信息學課后題及答案

1、生物信息學課后習題及答案生物信息學課后習題及答案（由10級生技一、二班課代表整理）一、緒論一、緒論1.你認為，什么是生物信息學？采用信息科學技術(shù)，借助數(shù)學、生物學的理論、方法，對各種生物信息（包括核酸、蛋白質(zhì)等）的收集、加工、儲存、分析、解釋的一門學科。2.你認為生物信息學有什么用？對你的生活、研究有影響嗎？（1）主要用于：在基因組分析方面：生物序列相似性比較及其數(shù)據(jù)庫搜索、基因預測、基因組進化和分子進化、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測等在醫(yī)藥方面：新

2、藥物設計、基因芯片疾病快速診斷、流行病學研究：SARS、人類基因組計劃、基因組計劃：基因芯片。（2）指導研究和實驗方案，減少操作性實驗的量；驗證實驗結(jié)果；為實驗結(jié)果提供更多的支持數(shù)據(jù)等材料。3.人類基因組計劃與生物信息學有什么關(guān)系？人類基因組計劃的實施，促進了測序技術(shù)的迅猛發(fā)展，從而使實驗數(shù)據(jù)和可利用信息急劇增加，信息的管理和分析成為基因組計劃的一項重要的工作。而這些數(shù)據(jù)信息的管理、分析、解釋和使用促使了生物信息學的產(chǎn)生和迅速發(fā)展。4簡

3、述人類基因組研究計劃的歷程。通過國際合作，用15年時間（19902005）至少投入30億美元，構(gòu)建詳細的人類基因組遺傳圖和物理圖，確定人類DNA的全部核苷酸序列，定位約10萬基因，并對其他生物進行類似研究。1990，人類基因組計劃正式啟動。1996，完成人類基因組計劃的遺傳作圖，啟動模式生物基因組計劃。1998完成人類基因組計劃的物理作圖，開始人類基因組的大規(guī)模測序。Celera公司加入，與公共領域競爭啟動水稻基因組計劃。1999，第五

4、屆國際公共領域人類基因組測序會議，加快測序速度。2000，Celera公司宣布完成果蠅基因組測序，國際公共領域宣布完成第一個植物基因組——擬南芥全基因組的測序工作。2001，人類基因組“中國卷”的繪制工作宣告完成。2003，中、美、日、德、法、英等6國科學家宣布人類基因組序列圖繪制成功，人類基因組計劃的.目標全部實現(xiàn)。2004，人類基因組完成圖公布。2.我國自主知識產(chǎn)權(quán)的主要基因組測序計劃有哪些？水稻（2002），家雞（2004），家蠶

5、（2007），家豬（2012），大熊貓（2010）二二第一章第一章2.TSS外顯子和內(nèi)含子的概念。TSS是轉(zhuǎn)錄起始位點（TranionStartSite）的英文縮寫，是指DNA上一段與RNA聚合酶結(jié)合并起始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。真核生物結(jié)構(gòu)基因，由若干個編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成，去除非編碼區(qū)再連接后，可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì)，這些基因稱為斷裂基因。其中的編碼區(qū)即為外顯子，非編碼區(qū)即為內(nèi)含子。3.如何判斷起始

6、密碼子？內(nèi)含子？AUG甲硫氨酸（met）內(nèi)含子（5’GT……AG3’）4.蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)有哪些？（1）螺旋（2）b折疊–平行折疊反平行折疊（3）b轉(zhuǎn)角–連接作用”U”型結(jié)構(gòu)（大多PheGly組成）（4）無規(guī)卷曲沒有確定規(guī)律性的肽鏈構(gòu)象，但仍是緊密有序的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)（5）無序結(jié)構(gòu)多肽鏈中有60％的區(qū)段為a螺旋和b折疊5、HGP選擇作為研究人類的四大“模式生物“有哪些？酵母、線蟲、果蠅、小鼠。6、背誦生物信息數(shù)據(jù)庫中的核苷酸代碼？52生物信息數(shù)

7、據(jù)庫中的核苷酸代碼NA或C或G或T（U）V非TSG或CH非GMA或CD非CRA或GB非AWA或T（U）TT（胸腺嘧啶）KG或T（U）GG（鳥嘌呤）YC或T（U）CC（胞嘧啶）UU（尿嘧啶）AA（腺嘌呤）代碼核苷酸代碼核苷酸NA或C或G或T（U）V非TSG或CH非GMA或CD非CRA或GB非AWA或T（U）TT（胸腺嘧啶）KG或T（U）GG（鳥嘌呤）YC或T（U）CC（胞嘧啶）UU（尿嘧啶）AA（腺嘌呤）代碼核苷酸代碼核苷酸生物信息數(shù)據(jù)庫