翠花生物信息學(xué)復(fù)習(xí)題

1、2012生物信息學(xué)復(fù)習(xí)題一、選擇題1.根據(jù)PAM打分矩陣，下列哪個(gè)氨基酸最不容易突變？A)丙氨酸AlaB)谷氨酰胺GlnC)甲硫氨酸D)半胱氨酸CysAla100，Gln93Met94Cys202.下列哪個(gè)句子最好描述了兩序列全局比對(duì)globalalignments和局部比對(duì)localalignments的不同？A)全局比對(duì)通常用于DNA序列，而局部比對(duì)通常用于蛋白質(zhì)序列；B)全局比對(duì)允許間隙，而局部比對(duì)不允許間隙；C)全局比對(duì)尋求全局

2、最大化，而局部比對(duì)尋求局部最大化；D)全局比對(duì)比對(duì)整條序列，而局部比對(duì)尋找最佳匹配子序列3.與PAM打分矩陣比較，BLOSUM打分矩陣的最大區(qū)別在哪里？A)它最好用于比對(duì)相關(guān)性很近的序列；B)它是基于近相關(guān)蛋白的全局多序列比對(duì)；C)它是基于遠(yuǎn)相關(guān)蛋白的局部多序列比對(duì)；D)它結(jié)合了局部和全局比對(duì)信息PAMmatricesarebasedonglobalalignmentsofcloselyrelatedproteins.4.全局比對(duì)算法（

3、如NeedlemanWunsch算法）是這樣一種算法：A)把兩條比較的蛋白質(zhì)放到一個(gè)矩陣中，然后通過(guò)窮盡搜索每一個(gè)可能的比對(duì)組合來(lái)尋找最佳分值的比對(duì)；B)把兩條比較的蛋白質(zhì)放到一個(gè)矩陣中，然后通過(guò)迭代遞歸的方法找到最佳的分值；C)把兩條比較的蛋白質(zhì)放到一個(gè)矩陣中，然后通過(guò)尋找最佳子序列的方法來(lái)找到最佳的比對(duì)；D)能用于蛋白質(zhì)，但不能用于DNA序列NWisguaranteedtofindoptimalalignmentsalthought

4、healgithmdoesnotsearchallpossiblealignments.Itisanexampleofadynamicprogrammingalgithm:anoptimalpath(alignment)isidentifiedbyincrementallyextendingoptimalsubpaths.Thusaseriesofdecisionsismadeateachstepofthealignmenttofind

5、thepairofresidueswiththebestsce.10.極值分布A）描述了對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)的query的sces的分布B）比正態(tài)分布的總面積大C）對(duì)稱D）形狀可用兩個(gè)參數(shù)來(lái)描述，即（平均值）和λ（衰減系數(shù)）11.當(dāng)blast檢索的E值減小時(shí)A）K值也減小B）sce變大C）概率p值變大D）極值分布偏斜率減小12.標(biāo)準(zhǔn)化的blastsce（也稱為bitsces）A）是沒(méi)有單位B）可在不同的blast檢索之間比較，即使使用了不同的打分矩

6、陣C）與使用的打分矩陣無(wú)關(guān)D）可在不同的blast檢索之間比較，但前提是使用相同的打分矩陣13.在EMBL和NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中未加工的DNA序列（與注釋序列相比）是A）完全重疊了B）很大程度上重疊了，不過(guò)序列不同C）相對(duì)只有一點(diǎn)重疊14.下面的哪種工作，PSIBLAST搜索最為有效A）在老鼠中找一個(gè)人類蛋白質(zhì)的同源蛋白B）在數(shù)據(jù)庫(kù)查詢中找到更多的匹配蛋白C）在數(shù)據(jù)庫(kù)查詢中找到更多的匹配DNA序列D）用模式序列或者信號(hào)序列加強(qiáng)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索15