翠花生物信息學復習題

1、2012生物信息學復習題一、選擇題1.根據(jù)PAM打分矩陣，下列哪個氨基酸最不容易突變？A)丙氨酸AlaB)谷氨酰胺GlnC)甲硫氨酸D)半胱氨酸CysAla100，Gln93Met94Cys202.下列哪個句子最好描述了兩序列全局比對globalalignments和局部比對localalignments的不同？A)全局比對通常用于DNA序列，而局部比對通常用于蛋白質序列；B)全局比對允許間隙，而局部比對不允許間隙；C)全局比對尋求全局

2、最大化，而局部比對尋求局部最大化；D)全局比對比對整條序列，而局部比對尋找最佳匹配子序列3.與PAM打分矩陣比較，BLOSUM打分矩陣的最大區(qū)別在哪里？A)它最好用于比對相關性很近的序列；B)它是基于近相關蛋白的全局多序列比對；C)它是基于遠相關蛋白的局部多序列比對；D)它結合了局部和全局比對信息PAMmatricesarebasedonglobalalignmentsofcloselyrelatedproteins.4.全局比對算法（

3、如NeedlemanWunsch算法）是這樣一種算法：A)把兩條比較的蛋白質放到一個矩陣中，然后通過窮盡搜索每一個可能的比對組合來尋找最佳分值的比對；B)把兩條比較的蛋白質放到一個矩陣中，然后通過迭代遞歸的方法找到最佳的分值；C)把兩條比較的蛋白質放到一個矩陣中，然后通過尋找最佳子序列的方法來找到最佳的比對；D)能用于蛋白質，但不能用于DNA序列NWisguaranteedtofindoptimalalignmentsalthought

4、healgithmdoesnotsearchallpossiblealignments.Itisanexampleofadynamicprogrammingalgithm:anoptimalpath(alignment)isidentifiedbyincrementallyextendingoptimalsubpaths.Thusaseriesofdecisionsismadeateachstepofthealignmenttofind

5、thepairofresidueswiththebestsce.10.極值分布A）描述了對數(shù)據(jù)庫的query的sces的分布B）比正態(tài)分布的總面積大C）對稱D）形狀可用兩個參數(shù)來描述，即（平均值）和λ（衰減系數(shù)）11.當blast檢索的E值減小時A）K值也減小B）sce變大C）概率p值變大D）極值分布偏斜率減小12.標準化的blastsce（也稱為bitsces）A）是沒有單位B）可在不同的blast檢索之間比較，即使使用了不同的打分矩

6、陣C）與使用的打分矩陣無關D）可在不同的blast檢索之間比較，但前提是使用相同的打分矩陣13.在EMBL和NCBI數(shù)據(jù)庫中未加工的DNA序列（與注釋序列相比）是A）完全重疊了B）很大程度上重疊了，不過序列不同C）相對只有一點重疊14.下面的哪種工作，PSIBLAST搜索最為有效A）在老鼠中找一個人類蛋白質的同源蛋白B）在數(shù)據(jù)庫查詢中找到更多的匹配蛋白C）在數(shù)據(jù)庫查詢中找到更多的匹配DNA序列D）用模式序列或者信號序列加強數(shù)據(jù)庫搜索15