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文檔簡介
1、隊列研究是一種研究復(fù)雜性疾病病因的重要方法。由于隊列研究需要對患者送行長期隨訪監(jiān)測,并對暴露資料和結(jié)局事件等大量數(shù)據(jù)進行采集、管理和分析,所以專門服務(wù)于隊列研究的信息系統(tǒng)應(yīng)運而生。傳統(tǒng)的隊列研究信息系統(tǒng)基本是針對特定的隊列研究目的定制開發(fā),但由于針對不同疾病、不同目的的隊列研究在數(shù)據(jù)采集和管理上具有共通性,導(dǎo)致了大量的重復(fù)勞動。
為了解決以上問題,本論文設(shè)計并開發(fā)了可配置的隊列研究信患系統(tǒng),實現(xiàn)了隊列數(shù)據(jù)采集、數(shù)據(jù)存儲和數(shù)據(jù)分
2、析的可配置。本論文的內(nèi)容包括:
1)首先調(diào)研了隊列研究的設(shè)計過程,然后分析了隊列研究信息系統(tǒng)在隊列研究中的作用。在此基礎(chǔ)上,調(diào)研并分析了隊列研究信息系統(tǒng)的研究現(xiàn)狀和功能特點。根據(jù)分析結(jié)果,傳統(tǒng)的隊列研究信息系統(tǒng)雖然具有類似的數(shù)據(jù)采集、管理和分析方法,但由于系統(tǒng)大多采用定制開發(fā)的方法,無法在多個隊列研究間復(fù)用,導(dǎo)致了開發(fā)力量的浪費,針對該問題本論文提出了一種可配置的隊列研究信息系統(tǒng)的解決方案。
2)針對不同隊列研究在暴
3、露資料和結(jié)局事件等數(shù)據(jù)采集的內(nèi)容上存在差別的特點,本論文利用國際上openEHR兩層建模方法研究了可配置數(shù)據(jù)采集技術(shù):根據(jù)openEHR參考模型定義的數(shù)據(jù)類型構(gòu)造不同類型的表單構(gòu)件,實現(xiàn)了數(shù)據(jù)采集表單的基本框架;設(shè)計了可視化表單設(shè)計器,可實現(xiàn)“所見即所得”的表單樣式動態(tài)調(diào)整;將數(shù)據(jù)項動態(tài)綁定到表單構(gòu)件實例上,可實現(xiàn)表單數(shù)據(jù)存儲和查詢的按需調(diào)整。
3)為了實現(xiàn)可配置數(shù)據(jù)分析,通過ETL(Extract-Transform-Loa
4、d)將不同數(shù)據(jù)源的數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成通用數(shù)據(jù)模型(OMOP Common Data Model,CDM)表達的通用格式。然而由于ETL的過程比較復(fù)雜,實現(xiàn)難度較大,提出了原型數(shù)據(jù)映射到CDM的改進方案。
4)設(shè)計并實現(xiàn)了可配置的隊列研究信息系統(tǒng),系統(tǒng)主要分為隊列建立和隊列分析兩個模塊。隊列建立包括數(shù)據(jù)采集、隨訪管理和數(shù)據(jù)管理;隊列分析包括CDM格式標(biāo)準(zhǔn)化以及基于CDM利用OHDSI提供的開源軟件工具和分析方法庫進行隊列研究數(shù)據(jù)分析。<
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