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文檔簡介
1、本論文共4章,分為三部分,第一部分(第一章)是關(guān)于本論文使用的一些基本理論和計算方法介紹,第二部分包括二章(第二章和第三章),主要是關(guān)于氣相賴氨酸和賴氨酸與一個水分子復合后的構(gòu)型和性質(zhì)研究,第三部分(第四章)是對所做的工作做一下總結(jié),具體內(nèi)容如下: 第一章,主要對本論文使用的一些計算方法和基本理論進行了簡單的介紹。首先回顧了量子化學的發(fā)展,介紹了Hartree-Fock理論,接著介紹了本論文所使用到的計算方法,從頭計算法和半經(jīng)驗
2、方法。隨后介紹了量子化學的另外幾個基本原理,包括電子相互作用、組態(tài)相互作用理論、耦合簇方法、微擾理論、密度泛函理論和含時密度泛函理論;最后,介紹了幾種溶劑化模型。 第二章,首先簡單介紹了組成蛋白質(zhì)基本結(jié)構(gòu)的20種氨基酸。然后詳細討論了我們尋找賴氨酸低能量構(gòu)型所使用的具體方法,給出了我們利用半經(jīng)驗方法、從頭算方法和密度泛函理論方法得到的氣相規(guī)范性、質(zhì)子化和去質(zhì)子化賴氨酸較穩(wěn)定的互變異構(gòu)體的結(jié)構(gòu)和能量,以及它們的一系列物理化學性質(zhì),
3、包括相對能、零點振動能、轉(zhuǎn)動常數(shù)、偶極矩、簡諧振動頻率、垂直電離能、質(zhì)子親和勢、質(zhì)子解離能、氣相酸性、氣相堿性、焓僮、吉布斯自由能以及在不同溫度下的構(gòu)型分布。 第三章,詳細討論了我們尋找氣相中賴氨酸與一個水分子復合體的低能量構(gòu)型所使用的具體方法,給出了尋找到的規(guī)范性和雙電性構(gòu)型及相關(guān)物理量。并把目光轉(zhuǎn)向更接近于賴氨酸真實存在環(huán)境的水溶液中來研究賴氨酸的結(jié)構(gòu)性質(zhì)。我們應用CPCM溶劑化模型研究賴氨酸在溶液中的能量,驗證了規(guī)范性構(gòu)型
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