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1、定量結(jié)構(gòu)-性質(zhì)相關(guān)(quantitative structure-property relationship,QSPR),定量結(jié)構(gòu)-活性相關(guān)者(quantitative structure-activity relationships QSAR)的研究已成為化學(xué)、環(huán)境、生命等學(xué)科研究中的一個前沿領(lǐng)域。分子拓?fù)渲笖?shù)作為從分子圖提取出來的不變量,能有效表征分子的大小、形狀、分支等結(jié)構(gòu)特征,以此建立定量結(jié)構(gòu)-性質(zhì)/活性模型并對分子的性質(zhì)/活性
2、進(jìn)行估算和預(yù)測,已成為分子結(jié)構(gòu)與性質(zhì)/活性關(guān)系QSPR/QSAR研究的重點和前沿。近些年來發(fā)展的量子化學(xué)通過表征分子的某種特征而實現(xiàn)分子結(jié)構(gòu)信息的數(shù)值化,量子化學(xué)方法能夠合理有效的對化合物分子層面進(jìn)行有效的表征。本文將分子拓?fù)浞椒ㄅc量子化學(xué)方法結(jié)合起來,將量子化學(xué)方法計算的部分結(jié)果引入分子的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)中,構(gòu)建新的分子量子拓?fù)渲笖?shù),從而實現(xiàn)對物質(zhì)的性質(zhì)/活性規(guī)律進(jìn)行量子拓?fù)浠瘜W(xué)的定量描述。
本文主要從以下方面進(jìn)行:
?。?
3、)結(jié)構(gòu)優(yōu)化和量化計算運用密度泛函理論(DFT),采用Gaussian03程序,在不同基組B3LYP水平上對硫醇、醛酮、硫醚等化合物的分子進(jìn)行幾何結(jié)構(gòu)的優(yōu)化。并對分子的Gibbs自由能(G)、恒容摩爾熱容(CV)、熵(S)、配分函數(shù)(lgQ)、最高占據(jù)軌道(HOMO)能量(eH)、最低空軌道(LUMO)能量(eL)、羰基碳氧原子的電荷(QC、QO)、偶極矩(m)、原子間的距離(d)等進(jìn)行理論計算。
?。?)指數(shù)構(gòu)建改進(jìn)硫醇、醛酮、
4、硫醚等化合物分子的距離矩陣,將原距離矩陣中原子的拓?fù)渚嚯x替換成量子化學(xué)計算的實際原子的空間距離,在矩陣的對角線上引入按原子的基團(tuán)電負(fù)性計算的原子的平衡電負(fù)性,計算改進(jìn)矩陣的最大特征值λmax,按式QT=logN*logλmax,計算得分子量子拓?fù)渲笖?shù)QT。
(3)模型建立將計算的分子量子拓?fù)渲笖?shù)QT結(jié)合Gaussian所計算的量化參數(shù),采用多元線性回歸分別建立硫醇、醛酮、硫醚等化合物性質(zhì)的回歸模型。所建硫醇8種性質(zhì)的模型大部分
5、回歸的R值在0.99以上;72個脂肪醛酮的沸點模型R>0.99,色譜保留指數(shù)模型 R>0.98;61個硫醚的四種色譜保留指數(shù)模型R>0.93,3個大于0.95??傮w上所建模型合理有效。
?。?)模型檢驗對所建立的模型采用留一交叉驗證法(LOO CV)及隨即抽樣法進(jìn)行驗證。將計算所得預(yù)測值與實驗值進(jìn)行比較,留一交叉檢驗法的多重相關(guān)系數(shù)RCV模型的R值接近,表明構(gòu)建的模型穩(wěn)健、合理、有效。
該方法有望在物質(zhì)的QSPR/QS
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