基于不同映射下基因序列功率譜分析及其閾值研究.pdf

1、伴隨著基因測(cè)序的不斷深入發(fā)展，多種物種的基因序列面紗被人類逐步揭開，了解基因序列結(jié)構(gòu)特征及功能成為人類日益關(guān)注的問題，其中較為突出的是基因預(yù)測(cè)問題。我國(guó)從事基因研究工作起步較晚，但一直以來投入的人力、物力相對(duì)較多同時(shí)也獲得了很多引起世界廣泛關(guān)注的成果。本文主要從現(xiàn)有研究的基礎(chǔ)上對(duì)堿基3-周期性進(jìn)行驗(yàn)證，并對(duì)基因預(yù)測(cè)過程中涉及到的閾值問題進(jìn)行了討論。
　　論文第一章介紹了基因預(yù)測(cè)的研究背景及意義、國(guó)內(nèi)外生物信息學(xué)研究進(jìn)展和基因預(yù)測(cè)研

2、究存在的問題及發(fā)展趨勢(shì)。第二章分為兩個(gè)部分，第一部分主要介紹了一些生物基礎(chǔ)知識(shí)，包括DNA模型構(gòu)建、基因與DNA序列的關(guān)系和生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫等;第二部分介紹了數(shù)字信號(hào)處理技術(shù)以及其中的數(shù)字映射方法，主要包括離散傅里葉變換和快速傅里葉變換、Voss映射、Z曲線映射以及與復(fù)數(shù)有關(guān)的四元數(shù)映射等，數(shù)字信號(hào)映射方法的選擇會(huì)影響到最終的預(yù)測(cè)結(jié)果。本文主要內(nèi)容是第三章和第四章，第三章在已有的外顯子具有堿基3-周期性而內(nèi)含子不具有堿基3-周期性這一結(jié)

3、論的基礎(chǔ)上，分別通過對(duì)家鼠和人類的外顯子序列和內(nèi)含子序列進(jìn)行功率譜分析驗(yàn)證了上述結(jié)論，驗(yàn)證結(jié)果顯示家鼠和人類的外顯子均具有堿基3-周期性，而內(nèi)含子都不具有堿基3-周期性的特性。由于利用Voss映射進(jìn)行功率譜分析的信噪比和利用Z曲線映射進(jìn)行功率譜分析的信噪比具有線性關(guān)系，本文數(shù)值實(shí)驗(yàn)結(jié)果同樣驗(yàn)證了此結(jié)論。第四章主要研究了基因預(yù)測(cè)中涉及到的閾值問題，閾值是通過傅立葉變換得到的能夠?qū)Φ鞍踪|(zhì)編碼區(qū)和非編碼區(qū)進(jìn)行區(qū)別的最優(yōu)信噪比，但生物學(xué)家通過對(duì)