組蛋白修飾及轉錄因子對染色質開放性影響的量化分析.pdf

1、DNA酶I超敏感位點是對于DNA酶I的水解異常敏感的染色質區(qū)域,這些區(qū)域大多位于有活性的基因和順式調節(jié)元件上。傳統上,這些區(qū)域被認為是開放染色質,而且對于很多重要的生物學活動,比如基因轉錄, DNA復制,細胞分化等,都有很重要的生物學作用。現在,人們已經知道,很多染色質上的生物學特征,比如組蛋白修飾、轉錄因子的結合對于染色質的開放性以及超敏位點的形成都有很重要的作用。
　　在本研究中,我們對整個基因組上DNA酶I超敏感位點區(qū)域染色

2、質的開放性與組蛋白修飾、轉錄因子的結合之間的關系,做了一下深入的分析。我們發(fā)現對于這些基因組上的特征而言,不同的特征對于染色質開放區(qū)域的偏愛是不同的。為了闡明它們之間確定的量化關系,我們利用這些基因組上的特征,構造了統計學模型直接去預測基因組的開放性程度,我們發(fā)現組蛋白修飾和轉錄因子的結合都能對基因組的開放性有很好的預測。而且,我們的結果也證實,這些特征之間是高度冗余的,只需要一小部分的特征就可以得到一個比較高的預測準確度。