基于智能算法的蛋白質(zhì)折疊研究.pdf

1、研究蛋白質(zhì)的折疊是生命科學(xué)領(lǐng)域的前沿課題之一。蛋白質(zhì)是一種生物大分子，是由20種氨基酸以肽鍵連接成肽鏈，在空間卷曲折疊成為特定的三維空間結(jié)構(gòu)。因?yàn)榈鞍踪|(zhì)只有在特定的三維空間結(jié)構(gòu)下才能發(fā)揮其各種與生命活動(dòng)息息相關(guān)的生物功能，因此了解蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)并進(jìn)一步了解如何形成特定的三級(jí)結(jié)構(gòu)成為了研究熱點(diǎn)，也就是所謂的蛋白質(zhì)折疊問題?；谶@個(gè)問題，主要在以下幾個(gè)方面進(jìn)行研究： 首先，分析蛋白質(zhì)折疊模型和能量?jī)?yōu)化函數(shù)，得出蛋白質(zhì)非格點(diǎn)模型和

2、簡(jiǎn)化能量函數(shù)在蛋白質(zhì)折疊研究中的必要性，并設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)基于非格點(diǎn)模型的蛋白質(zhì)折疊的能量計(jì)算模塊。其次，由于智能算法具有魯棒性和較好的尋優(yōu)能力的特點(diǎn)，因而研究遺傳算法、蟻群算法和粒子群三種智能算法并將它們應(yīng)用蛋白質(zhì)折疊研究。再次，將近年來新提出的人工魚群算法應(yīng)用于蛋白質(zhì)折疊的模擬并進(jìn)行重點(diǎn)研究。對(duì)折疊結(jié)果進(jìn)行相應(yīng)的分析，結(jié)果表明人工魚群算法在蛋白質(zhì)折疊過程具有較好的全局尋優(yōu)能力，更容易找到最優(yōu)解。最后，為了實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)折疊過程的可視化，以虛擬現(xiàn)