非洲栽培稻基因滲入系DNA指紋圖譜的構(gòu)建.pdf

1、重復(fù)序列(SSR)標(biāo)記的應(yīng)用有助于區(qū)分水稻中的高度多態(tài)性，是用于估計近緣基因型間遺傳多樣性的主要手段。本研究中，共使用22個微衛(wèi)星分子標(biāo)記對21個水稻品種（3個來自中國的品種和18個攜帶非洲栽培稻基因的新滲入系）的特征和特異性進(jìn)行分析.本研究旨在建立非洲栽培稻基因滲入系的DNA指紋圖譜數(shù)據(jù)庫，用于為非洲栽培稻基因滲入系提供遺傳鑒定和親緣關(guān)系分析。
　　本研究中，利用改良CTAB法提取幼苗幼葉的基因組DNA，在2.0％瓊脂糖凝膠上分

2、離PCR產(chǎn)物，以溴化乙錠染色并在紫外光拍攝。PCR產(chǎn)物在6％變性聚丙烯酰胺凝膠上電泳，利用硝酸銀法對凝膠進(jìn)行染色顯影。以SSR方法，通過PCR技術(shù)篩選多態(tài)性，并已獲得的多態(tài)性豐富的標(biāo)記帶型。每個位點的等位基因數(shù)變幅為2-6個，平均等位基因數(shù)為4.1。
　　結(jié)果表明，不同基因型間的遺傳差異可進(jìn)一步用于材料鑒定。通過聚類分析將21個材料歸為8組，與其系譜表現(xiàn)基本一致。其中ILA65和ILA78差異最?。ㄏ嗨葡禂?shù)0.98）。J23B與其

3、他基因型間的差異表現(xiàn)最大，其相似系數(shù)在0.35左右。主成分分析表明，PC1貢獻(xiàn)率最高，達(dá)65.1389％，其次是PC2為7.8560％，這2個因子的累積方差為72.9948％。這與通過加權(quán)配對組算術(shù)方法(UPGMA)獲得的聚類分析結(jié)果相近。所有基因型之間的相似系數(shù)介于0.2308和0.9780之間，平均相似度0.6807。ILA65和ILA78之間相似度最高(0.9780)，ILA19和J23B，ILA123和J23B之間的相似度最低(

4、0.2308)。J23B與所有其它基因型的相似系數(shù)在0.2308至0.4396。
　　在篩選獲得的22對遺傳多態(tài)性較好的引物中，RM297，RM208，RM337，RM336, RM213, RM26, RM342, RM186, RM202, RM310, RM80, RM274和RM121能穩(wěn)定擴(kuò)增，清晰易讀。這對于材料鑒定和DNA指紋圖譜數(shù)據(jù)庫的構(gòu)建具有一定意義。
　　最后，我們?yōu)槊總€基因型創(chuàng)建了可用于鑒定的唯一編碼。