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1、本課題將以EHEC O157:H7 Stx2的晶體結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ),輔以DNAStar軟件分析,預(yù)測(cè)并篩選靶向Stx2 A1片段毒性活性中心的保護(hù)性B細(xì)胞表位肽,利用此肽制備靶向Stx2毒性活性中心的中和性單克隆抗體,在此基礎(chǔ)上制備Fab基因工程抗體,以期獲得具有臨床治療價(jià)值的中和性抗體。本研究主要分四個(gè)部分: 第一部分基于EHEC O157:H7 Stx2晶體結(jié)構(gòu)的B細(xì)胞表位肽的預(yù)測(cè)與免疫原性鑒定 Stx2保護(hù)性B細(xì)胞表位
2、肽的預(yù)測(cè)與鑒定是利用保護(hù)性B細(xì)胞表位肽為抗原靶向性制備Stx2中和性抗體的第一步。本部分研究是首先在NCBI的結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索EHECO157:H7的Stx2以及Stx2與配體腺嘌呤復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)解析圖。基于Stx2與配體腺嘌呤相互作用的立體結(jié)構(gòu),依據(jù)B表位肽的預(yù)測(cè)原則,選取Stx2 A1毒性片段上的4條氨基酸肽段,采用DNAStar軟件對(duì)預(yù)測(cè)的4條氨基酸肽段進(jìn)行親水性、表面可及性、可塑性、二級(jí)結(jié)構(gòu)抗原性等參數(shù)進(jìn)行評(píng)價(jià),通過BLAST檢索
3、比較被預(yù)選B細(xì)胞表位肽與人、兔、鼠的同源性后,最終確定本研究所用的4條可能的B表位多肽序列,分別為Pl、P2、P3、P4人工合成4條B表位肽,并且均偶聯(lián)載體蛋白鑰孔戚血藍(lán)素后分別免疫日本大耳兔,鑒定其免疫原性,間接ELISA結(jié)果顯示:4條合成多肽均能刺激日本大耳兔產(chǎn)生抗多肽和天然Stx2的抗體,抗血清與天然Stx2反應(yīng)的效價(jià)P2>P1>P3>P4;Dot ELISA結(jié)果顯示:4條B細(xì)胞表位肽制備的兔多克隆抗體能特異的與B細(xì)胞表位肽、St
4、x2和載體蛋白KLH反應(yīng);Western blot結(jié)果顯示:4條B細(xì)胞表位肽誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生特異針對(duì)Stx2 A亞單位的多克隆抗體,以上結(jié)果表明預(yù)測(cè)的4條多肽具有免疫原性,能刺激機(jī)體產(chǎn)生特異的抗Stx2A亞單位的抗體,確為B細(xì)胞表位肽。用4條B細(xì)胞表位肽免疫Balb/c小鼠后,以天然Stx2攻毒,篩選出的P1多肽為保護(hù)性B細(xì)胞表位肽,該表位肽包括Stx2毒性活性位點(diǎn)即位于Stx2 A1片段的第77位氨基酸-酪氨酸,為靶向Stx2毒素活性中心
5、的中和性單克隆抗體的研制奠定了基礎(chǔ)。 第二部分基于EHEC O157:H7 Stx2 B細(xì)胞表位肽的中和性MAb制備與生物學(xué)鑒定 本部分研究是在第一部分成功獲得包含Stx2毒性活性中心的P1保護(hù)性B細(xì)胞表位肽的基礎(chǔ)上,靶向性制備抗Stx2中和性單克隆抗體,并對(duì)單抗的生物學(xué)活性進(jìn)行了鑒定。首先,以偶聯(lián)載體蛋白KLH的P1保護(hù)性B細(xì)胞表位肽為免疫原,在應(yīng)用傳統(tǒng)的雜交瘤技術(shù)的基礎(chǔ)上,采用含HAT的甲基纖維素半固體培養(yǎng)基和以天然
6、Stx2為篩選抗原的間接ELISA方法,快速篩選針對(duì)Stx2的單克隆雜交瘤細(xì)胞株。結(jié)果從1700個(gè)單克隆雜交瘤細(xì)胞中篩選出7株穩(wěn)定分泌抗天然Stx2的單克隆雜交瘤細(xì)胞株,染色體核型鑒定結(jié)果顯示:1F2、18C3、1G1和6834株雜交瘤細(xì)胞的染色體數(shù)目分別為106、100、98和104,接近小鼠脾細(xì)胞與Sp2/0骨髓瘤細(xì)胞染色體數(shù)目的總和,說明1F2、18C3、1G1和6834株雜交瘤細(xì)胞為小鼠脾細(xì)胞與Sp2/0細(xì)胞的融合體。而9D7、
7、8D4和11D3的染色體數(shù)目分別140、144和142,比小鼠脾細(xì)胞與Sp2/0骨髓瘤細(xì)胞染色體數(shù)目的總和約多40條,與2個(gè)脾細(xì)胞與1個(gè)SP2/0細(xì)胞的三倍體雜交瘤細(xì)胞的染色體數(shù)目相似;Dot-ELISA和Western Blot鑒定結(jié)果顯示:1F2、18C3、1G1、6834株單抗為Stx2 A亞單位特異的單克隆抗體,而8D4、11D3、9D73株單抗與KLH有交叉反應(yīng),結(jié)合3株雜交瘤細(xì)胞的染色體數(shù)目為三倍體的結(jié)果,推測(cè)其原因可能是一
8、個(gè)單克隆細(xì)胞株融合了針對(duì)Stx2和KLH兩種抗原決定簇的B淋巴細(xì)胞染色體;單克隆抗體的亞類鑒定結(jié)果顯示:1F2、386、1G1和18C34株天然Stx2特異的單克隆抗體均屬于IgG1κ型:1F2、386、1G1和18C34株單抗的抗體親和力常數(shù)鑒定結(jié)果分別為1.7×10-9、6.3×10-8、5.7×10-7和9×10-7。 體外細(xì)胞毒阻斷試驗(yàn)表明1F2、18C3、1G1和6834株單克隆均有中和Stx2的作用,4株單抗中和作用
9、相比:1F2>18C3>1G1=683;同時(shí)高劑量的單抗具有明顯的預(yù)防保護(hù)作用;體外單克隆抗體治療保護(hù)試驗(yàn)研究顯示:1F2和18C3的高劑量組有一定的治療保護(hù)作用,而且加入抗體越早中和作用越明顯,一旦毒素與細(xì)胞結(jié)合則抗體不能發(fā)揮保護(hù)作用,同時(shí)結(jié)果顯示1G1和683沒有明顯的治療保護(hù)作用,其原因可能與2株抗體的親和力較低有關(guān)。此外,P1B細(xì)胞表位肽體外競(jìng)爭(zhēng)抑制1F2單克隆抗體對(duì)Stx2毒性中和作用試驗(yàn)結(jié)果表明:P1B細(xì)胞表位肽與Stx2具
10、有相同的毒性活性表位,因此本研究選用體外實(shí)驗(yàn)證明預(yù)防保護(hù)作用最強(qiáng)的1F2單抗作為動(dòng)物體內(nèi)保護(hù)作用研究的對(duì)象。 本部分研究表明:制備的抗Stx2毒性活性中心的單克隆抗體1F2具有高特異性、高親和力,在動(dòng)物體內(nèi)能有效中和Stx2毒素,具有良好預(yù)防和治療作用。為臨床上使用抗Stx2的特異性抗體治療EHEC O157:H7感染,預(yù)防HUS和TTP等并發(fā)癥的出現(xiàn),提供了可能。 第三部分 EHEC O157:H7 Stx2中和性Fa
11、b抗體的構(gòu)建及基因結(jié)構(gòu)分析 鼠源性單克隆抗體的異源性,限制了其在臨床治療中的應(yīng)用,本部分研究采用基因工程技術(shù)將1F2中和性單抗改造成Fab基因工程抗體。首先從分泌抗Stx2毒性活性中心的中和性單克隆抗體雜交瘤細(xì)胞株1F2中提取總RNA,以提取的總RNA為模板,采用One step PT-PCR試劑盒,以根據(jù)鼠免疫球蛋白不同家族的可變區(qū)基因序列設(shè)計(jì)的7對(duì)K輕鏈引物和8對(duì)IgG1重鏈Fd片段引物,分別擴(kuò)增1F2抗體的K輕鏈和Fd片段
12、基因,將釣取的抗體κ鏈和Fd鏈基因構(gòu)建至Fab抗體表達(dá)載體Pcomb3X,并切除Pcomb3X載體上的噬菌體外殼蛋白III的基因后,轉(zhuǎn)化XL-Blue菌。 本部分研究成功構(gòu)建了1F2Fab抗體的表達(dá)載體,基因測(cè)序結(jié)果顯示:1F2Fab抗體的κ鏈為648bp,F(xiàn)d1鏈為636bp,采用生物信息學(xué)方法對(duì)所得Fab抗體序列與現(xiàn)有已報(bào)道的其它各種抗體基因進(jìn)行同源性比較,分析其胚系基因來源,結(jié)果κ鏈基因序列與鼠抗體的κ鏈的胚系基因以及Fd
13、鏈基因序列和鼠抗體重鏈的胚系基因具有較高的一致性,分別為92%和87%,且和現(xiàn)有報(bào)道的各種其它已知抗體基因序列均不完全一致。說明1F2Fab抗體的基因的確來自小鼠胚系基因。根據(jù)1F2Fab抗體基因序列,經(jīng)計(jì)算機(jī)軟件推導(dǎo)出編碼1F2Fab抗體的Fd鏈編碼212個(gè)氨基酸,分子量為22436.31Da;1F2Fab抗體的κ編碼216個(gè)氨基酸,分子量為23882.52Da。將1F2Fab抗體的氨基酸序列提交SWISS-MODEL在線工具,經(jīng)分子
14、模建對(duì)其三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)并提交PDB數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),結(jié)果顯示:1F2Fab抗體的Fd鏈具有鼠Fab抗體重鏈結(jié)構(gòu)特征,可變區(qū)位于1-108位氨基酸;1F2Fab抗體的κ鏈具有鼠Fab抗體輕鏈結(jié)構(gòu)特征,可變區(qū)位于1~106位氨基酸。Fd鏈的cDR1、CDR2和CDR3的區(qū)域分別為20aa~27aa、45aa~52aa和91a~100aa;κ鏈的CDR1、CDR2和CDR3的區(qū)域分別為24aa~34aa,52aa~54aa和91aa~98aa。F
15、d鏈氨基酸序列的第16、90、137、192、212位氨基酸和κ鏈氨基酸序列的第21、91、137、197、216位氨基酸均為半胱氨酸,可以形成鏈內(nèi)和鏈間二硫鍵。 第四部分EHEC O157:H7 Stx2中和性Fab抗體的可溶表達(dá)及生物學(xué)功能研究 本研究將Pcomb3X-1F2Fab重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化XL-blue工程菌,30℃下經(jīng)IPTG誘導(dǎo)14h,收集誘導(dǎo)后重組工程菌超聲破菌上清。間接ELlSA檢測(cè)重組工程菌超聲破菌上清
16、,出現(xiàn)陽(yáng)性結(jié)果;SDS-PAGE檢測(cè)顯示:在Mr約為23KDa處出現(xiàn)1條新的蛋白表達(dá)帶,與1F2Fabκ鏈和Fd鏈預(yù)測(cè)的分子量相近,說明重組子Pcomb3-1F2Fab/XL-blue在IPTG的誘導(dǎo)下能分泌性表達(dá)具有與天然Stx2特異結(jié)合的1F2Fab抗體,但凝膠成像分析系統(tǒng)掃描分析結(jié)果顯示1F2Fab抗體的表達(dá)量低,約為2%。采用Protein L Resin抗體親和層析柱純化1F2Fab抗體,純化后樣品經(jīng)SDS-PAGE后,采用凝
17、膠成像分析系統(tǒng)掃描分析蛋白純度為95%。Western blot結(jié)果表明,純化后的1F2Fab抗體能與相應(yīng)轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜上的天然Stx2 A亞單位蛋白在32KDa處形成單一的蛋白質(zhì)染色帶;競(jìng)爭(zhēng)ELISA檢測(cè)結(jié)果表明,1F2Fab抗體能與親本鼠單抗1F2競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合同一抗原表位,且競(jìng)爭(zhēng)作用隨著抗體濃度增加而加強(qiáng)。根據(jù)50%抑制率時(shí)1F2Fab與親本鼠單抗1F2抗體濃度的比值,可計(jì)算出1F2Fab的親和力為親本鼠單抗1F2的85%。間接E
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