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文檔簡介
1、骨形態(tài)發(fā)生蛋白(BMPs)是TGF-β超家族中最大和增速最快的成員,近年來,隨著研究成果的不斷深入,發(fā)現(xiàn)其不光在誘導軟骨及骨組織定向分化中作用強大,在中胚層誘導、肢體發(fā)育、牙齒發(fā)育、造血細胞形成及動物繁殖性狀表達等方面也起著重要作用。本研究在實驗室前期工作的基礎上,對BMPs進行克隆測序及電子克隆分析,研究了新西蘭白兔在不同發(fā)育時期及不同組織中的時空差異性表達,以期確定BMPs在不同發(fā)育階段中所起的作用,從基因角度闡明新西蘭白兔的組織表
2、達譜規(guī)律。根據(jù)NCBI中GenBank已經(jīng)公布的人、豬、牛、綿羊、小鼠和大鼠骨形態(tài)發(fā)生蛋白2(BMP-2)和骨形態(tài)發(fā)生蛋白4(BMP-4)的序列,利用計算機軟件DNAMAN進行基因序列的同源性比對,找出BMP-2基因和BMP-4基因cDNA的保守區(qū)域,設計特異性引物,采用RT-PCR技術(shù)克隆這兩種基因,利用克隆的序列作為探針繼續(xù)進行電子克隆,用生物信息學軟件對兩種基因的分子結(jié)構(gòu)和特征進行分析和預測,然后采用實時熒光定量PCR方法在mRN
3、A水平上檢測兩種基因在新西蘭白兔不同發(fā)育時期中卵巢、子宮、輸卵管、腎臟、肝臟、脾臟和十二指腸組織的表達情況。
通過上述方法得出如下試驗結(jié)果:
1、根據(jù)保守區(qū)域,設計特異性引物,采用RT-PCR方法從新西蘭白兔卵巢、輸卵管、子宮中擴增BMP-2和BMP-4基因部分cDNA序列,片段長度分別為299bp和175bp。
2、分別以克隆測序出的BMP-2和BMP-4部分cDNA序列為探針,在nr數(shù)據(jù)庫及EST數(shù)據(jù)庫
4、中電子克隆兩個基因,克隆后的BMP-2基因為1150bp,BMP-4基因為920bp。
3、應用生物信息學軟件分析電子克隆BMP-2和BMP-4基因,其中BMP-2基因CDS區(qū)全長1149bp,編碼383個氨基酸;BMP-4基因CDS區(qū)全長918bp,編碼306個氨基酸。
4、利用生物信息學方法和相關(guān)軟件分析新西蘭白兔BMP-2和BMP-4基因的同源性,試驗結(jié)果表明:新西蘭白兔BMP-2基因核苷酸序列與羊(XM004
5、014353)一致性為86%,與牛(BC134682)一致性為86%,與豬(EU854587)一致性為86%,與小鼠(BC100344)一致性為93%,與大鼠(L20678)一致性為93%,與人(AB463447)一致性為87%;新西蘭白兔BMP-4基因核苷酸序列與羊(AF508312)一致性為93%,與牛(NM001045877)一致性為94%,與豬(EU334835)一致性為94%,與小鼠(BC013459)一致性為91%,與大鼠(
6、NM012827)一致性為92%。
5、通過實時熒光定量PCR技術(shù)檢測到新西蘭白兔BMP-2基因在30日齡、60日齡和180日齡中卵巢組織中相對表達含量最高,在120日齡中肝臟組織中相對表達量最高;而BMP-4基因則在60日齡和180日齡中卵巢組織表達含量最高,30日齡中十二指腸表達含量最高,妊娠6天的母兔中肝臟表達含量最高。
6、兩基因同一組織在不同生長發(fā)育時期的表達規(guī)律表現(xiàn)為:卵巢中BMP-2的mRNA變化幅度最
7、大,60日齡達到最高峰,輸卵管、子宮、脾臟均在120日齡時表達含量最高,30日齡時肝臟表達含量最高;卵巢中BMP-4的mRNA在60日齡時表達含量最高,輸卵管、子宮、腎臟、肝臟、脾臟則在妊娠6天母兔中表達含量最高,十二指腸在30日齡表達含量最高。
7、BMP-2基因和BMP-4基因在卵巢組織中都有較一致的表達趨勢,即60日齡最高,后下降,到180日齡又呈現(xiàn)上升趨勢。在十二指腸中的表達也存在明顯的相似性,即隨著日齡的增大,兩基因
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