mba論文兩個水稻參考基因組序列組裝質(zhì)量的評估和基于混合池進(jìn)行全基因組測序的方法研究pdf_第1頁
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文檔簡介

1、分類號華中農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文密級兩個水稻參考基因組序列組裝質(zhì)量的評估和基于混合池進(jìn)行全基因組測序的方法研究EvaluationofTheTwoRiceReferenceSequenceAssembliesandPoolingbasedWholeGenomeSequencing博士研究生：潘永龍學(xué)號：09304010004指導(dǎo)教師：羅美中教授指導(dǎo)小組：張紅雨教授劉克德教授嚴(yán)建兵教授匡漢暉教授陳玲玲教授專業(yè)：生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究方向：

2、基因組學(xué)獲得學(xué)位名稱：理學(xué)博士獲得學(xué)位時(shí)間：2014年6月華中農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院二O一四年六月華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2014屆博士研究生學(xué)位(畢業(yè))論文233三個圖譜之間的差異27234跨過IRGSPl0中物理缺口的克隆重疊群4024討論4025更多的補(bǔ)充研究4326BES序列號一433基于混合池進(jìn)行全基因組測序的方法研究一4431前言4432材料和方法一45321方法流程45322模擬數(shù)據(jù)的準(zhǔn)備46323混合池構(gòu)建策略47324BAC文

3、庫和混合池構(gòu)建49325不同參數(shù)條件下的計(jì)算機(jī)模擬50326實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的混合池構(gòu)建和DNA提取50327混合池DNA測序51328克隆特征序列和Kmer集合解析52329構(gòu)建物理圖譜533210序列組裝并整合到物理圖譜上533211序列定位與驗(yàn)證5433結(jié)果與分析一54331基本定義54332算法詳述59333模擬數(shù)據(jù)的處理64334模擬結(jié)果70335實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證結(jié)果9034討論91341指紋圖譜方法的不足及與測序方法比較91342參數(shù)討論9

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