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文檔簡介
1、中文 中文 5400 字, 字,3700 單詞, 單詞,2 萬英文字符 萬英文字符出處: 出處:Ki?Raz N, Sagli?K I, Ki?Remi?Tci? A, et al. Evaluation of the GenoType Mycobacteria Direct assay for direct detection of the Mycobacterium tuberculosis complex obtained fro
2、m sputum samples.[J]. Journal of Medical Microbiology, 2010, 59(8):930-934.分枝桿菌基因型直接檢測痰標本對檢測結核分枝桿菌 分枝桿菌基因型直接檢測痰標本對檢測結核分枝桿菌復合體的評價 復合體的評價Nuri Kiraz, Imran Saglik, Abdurrahman Kiremitci, Nilgun Kasifoglu and Yurdanur Akgun摘
3、要 摘要近年來結核?。═B)患病率的增加加快了新的結核感染的快速診斷工具的出現。這項研究評估痰標本的分枝桿菌基因型(GTMD)的直接檢測來檢測結核分枝桿菌復合體(MTBC),它與傳統(tǒng)的方法相比。GTMD 方法是一種商業(yè)的測定,基于核酸序列的擴增技術。這個方法可以基于23S rRNA 基因擴增檢測 MTBC,鳥分枝桿菌,胞內分枝桿菌,堪薩斯分枝桿菌等。通過凈化的臨床樣本在 6 h 內完成。在本研究中,115 例痰標本處理,使用顯微鏡方法
4、(苯酚品紅和熒光染色法),兩種培養(yǎng)方法羅氏培養(yǎng)和 BACTEC 培養(yǎng)法,及 GTMD 法檢測抗酸桿菌(AFB)。結果表明,86 例樣本直接鏡檢陽性,84 例 BACTEC 培養(yǎng)陽性,73 呈羅氏培養(yǎng)陽性,95GTMD 法呈陽性。所有的菌株都是 MTBC。此外,GTMD 法檢測患者 MTBC 的敏感性和特異性分別為 97%和 58%,結合培養(yǎng)法作為金標準。GTMD 法與行抗結核病治療的患者的樣本培養(yǎng)相比,測試的敏感性和特異性分別為 100
5、 和 15%。低的特異度可能因為抑制了結核菌的增值。由于這兩種方法的目標為相同的活菌,不同之處是顯著的。當結合培養(yǎng)結果和臨床表現對患者進行評估(真陽性標本),所有患者的 GTMD 法的敏感性和特異性值分別為 97%和 90%。然而,當患者接受抗結核治療后這兩個值會提高到 100%。這些結果暗示,為確定患者的痰是否包含活的 AFB,應在患者的隨訪過程中采用的更敏感的技術。以上結果表明,GTMD 法可以作為臨床和影像學懷疑結核病但分枝桿菌涂
6、片陰性的病例的早期診斷方法。此外,在涂片陽性的情況下使用 GTMD 法對于快速鑒別 MTBC是有益的且實用的,這允許了更快速的處理決定和感染控制措施。簡介 簡介結核?。═B)仍然是一個重要的社區(qū)衛(wèi)生問題。據世界衛(wèi)生組織估計,每年 800 萬新發(fā)結核病例,現報道是在 2-3 萬患者死亡的原因。每一個未經治療的肺結核病人一年導致 10-15 多人疾病的傳播。這使得結核病成為感染性疾病死亡的最重要原因之一。最有效保護的手段是在疾病的早期診斷和
7、治療。初步診斷根據臨床發(fā)現,但確定診斷基于實驗室的方法。結核病診斷的金標準是培養(yǎng),但耗時長。因此,分子生物學方法可用于鑒別。在過去的十年中,已經開發(fā)了幾種分子生物學方法直接檢測和鑒定臨床標本中結核分枝桿菌復合體(MTBC)。分枝桿菌基因型直接檢測(GTMD 法)是一個商業(yè)化的利用 DNA 探針檢測技術和反向雜交技術的一種方法法。這個方法直接從凈化的臨床樣本鑒定分枝桿菌分子。在我們的研究中,我們的目的是通過使用兩種不同的方法(苯酚品紅和熒
8、光染料)染色直接鏡檢檢測細菌的存在下,結合一個分子的方法,GTMD 法,與傳統(tǒng)的培養(yǎng)方法對比,檢測感染患者的痰標本。上一節(jié)下一個節(jié)方法 方法患者和應變 患者和應變總體而言,目前的研究結果表明, 115 痰標本檢測分枝桿菌中 84 例 BACTEC 培養(yǎng)法陽性,73 例羅氏培養(yǎng)法陽性,95 例 GTMD 法呈陽性???17 痰標本所有檢查均為陰性, 98 例至少其中一種方法陽性。此外,我們采用直接鏡檢檢測到 86 個痰標本中的 AFS。為
9、了提高靈敏度,我們準備了兩個直接和兩個均質凈化為每一個病人的痰標本涂片。當我們均質凈化痰標本涂片檢查,我們發(fā)現在 86 和 66 個樣本,分別使用熒光燈及苯酚品紅染色檢查。由于苯酚品紅染色陽性患者的熒光染色也呈陽性,我們用熒光染色涂片制備勻漿凈化痰標本直接鏡檢結果。石炭酸品紅染色結果表明,66 個樣本中,15 個患者痰標本中 AFB 均為陰性,全部 66 個均質凈化痰標本涂片均陽性。同樣,雖然 86 制備勻漿凈化痰標本熒光染色涂片呈陽性
10、,10 例痰標本涂片為陰性。檢驗這些不同的樣品中,我們把從均質化和凈化的痰標本涂片制備了細菌描述為'+',中等數量的細菌為“+ +”。因此,目前的研究結果表明,只有少數的細菌直接涂片 AFB 增長可能無法檢測到。此外,而只有少數幾個苯酚品紅染色培養(yǎng)('+'),并從少量痰直接涂片,勻漿凈化痰涂片染色呈陰性。這一觀察結果暗示,痰標本直接涂片往往無法檢測到結核菌的增長,可能會浪費時間和工作量。然而,直接涂片對少
11、量痰標本是有用的,可能是同質化和凈化程序稀釋樣品,導致結核菌的減少。染色和培養(yǎng)方法的比較示于表 1 中。用熒光染色,我們發(fā)現 31 個痰標本中 7 個陽性,但并沒有顯示出任何增長。這 7 個痰標本取自抗結核治療下的患者。與培養(yǎng)相比,熒光染色法的敏感性和特異性分別為 94%和 77%。GTMD 測試結果和直接顯微鏡比較示表 1 中。有兩個 GTMD 陽性而熒光染色陰性的樣本。這些樣品取自抗結核治療下的病人,這 2 個樣本的細菌密度為被確定
12、為“+”,該樣品沒有表現出增長。我們得出的結論是,該樣品檢驗陽性可能是由于存在死菌。同樣地,其他樣品的細菌密度被確定為“+”。樣本取自未抗結核治療的一個病人,并在 18 天內表現出增長(BACTEC)。由于我們觀察到 GTMD 內部控制放大頻帶上的條帶,在樣品中的抑制劑的存在下,不考慮結果假陰性。相比直接顯微鏡檢查,GTMD 測試其敏感性,特異性和陽性預測值(PPV)和陰性預測值(NPV)分別為 98,62,88 和 90%。84 個和
13、 73 個痰標本分別在 BACTEC 和的羅氏培養(yǎng)基檢查呈陽性。羅氏培養(yǎng)基上的所有的增長模式是一致 MTBC(淺奶油色,粗糙,面包屑狀菌落)。BACTEC 培養(yǎng)基生長地由 NAP 試驗來確定為 MTBC。此外,82/84 的痰標本 GTMD 法培養(yǎng)陽性也驗證為陽性(表 1 )。其余兩個樣本的培養(yǎng)陽性,但 GTMD 陰性。直接鏡檢檢查陰性的情況下行 GTMD 法。GTMD 測試陰性,可能是由于在此樣品中只有少數細菌的存在。同樣,其他樣本的
14、細菌密度直接鏡檢檢查后確定為“+”,這個樣品是取自沒有收到抗結核治療的病人。由于我們 GTMD 法檢測到內部控制放大頻帶,不考慮樣品中的抑制劑的發(fā)生和假陰性的結果,解釋為由于只有少數細菌存在的。此外,GTMD 測試呈陽性的 13 個痰標本沒有表現出生長,其中 11 個患者獲得了抗結核治療,其中六個,我們檢測陽性后,直接鏡檢評估。13 痰液樣品(沒有增長的培養(yǎng),但 GTMD 為陽性)其他兩個 AFB 陰性,采樣時間取在沒有收到抗結核治療的
15、患者,與不同的肺部疾病診斷。然而,沒有關于這兩例患者的結核感染病史。當與培養(yǎng)相比,敏感性,特異性,PPV 和 NPV 的 GTMD 法分別為 97,58,86 和 90%。當培養(yǎng)結果和臨床表現的患者進行了評估(真陽性標本)(佛朗哥·阿爾瓦雷斯月神等人,2006 ; Piersimoni 等,2002),其敏感性,特異性,PPV 和 NPV GTMD 試驗分別為 97,90,97 和 90%。我們注意到接受抗結核治療和那些沒有接
16、受抗結核治療的結核病患者之間的差異。115 個樣本中 88 個不接受結核病治療的患者(表 2)GTMD 的敏感性,特異性,陽性預測值和陰性預測值的沒有抗結核治療的患者接受測試確定分別為 97,89,97 和 89%。超過 2 個月的抗結核治療的患者在獲得的 27 個樣品的結果總結在表 3 。在這些患者中,GTMB 法其敏感性,特異性,PPV 和 NPV 為 100,15,56 和 100%。當培養(yǎng)結果和臨床癥狀的患者進行了評估(真陽性標
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