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文檔簡介
1、目的:本實驗通過分析正常對照組、2型糖尿?。═2D)患者和糖尿病前期患者血漿微小核糖核酸( miRNA)表達譜的變化,發(fā)現(xiàn)差異表達的miRNAs,并從血漿miRNA水平探討T2D的發(fā)病機制,為T2D早期診斷尋找可能的新的生物標志物。
方法:(1)采集糖尿病前期組、T2D組和健康對照組各3例血漿,提取RNA,利用安捷倫miRNA芯片檢測miRNAs表達量,并根據(jù)芯片結(jié)果,從中挑選兩兩對比表達均有顯著性差異的miRNAs以進行后續(xù)
2、驗證分析。(2)于2014年3月~2015年10月,收集年齡及性別匹配的、由貴州省人民醫(yī)院內(nèi)分泌科門診確診為T2D和糖尿病前期病人以及同期健康體檢正常者各50例血漿樣本,對研究對象的臨床數(shù)據(jù)進行分析,并提取樣本RNA,采用SYBR Green法進行實時熒光定量聚合酶鏈式反應(yīng)(qRT-PCR)驗證差異表達的miRNAs在3組樣本中的表達情況。(3)在生物信息學數(shù)據(jù)庫—Targetscan、microRNAorg和pita,對miRNA靶基
3、因進行預(yù)測,得到在3個數(shù)據(jù)庫均有預(yù)測的miRNA靶基因并分析其生物學功能。(4)最后用統(tǒng)計學分析并進一步建立受試者工作曲線(ROC曲線),再通過計算ROC曲線下面積(AUC)來判斷每一個miRNA的臨床診斷能力。
結(jié)果:(1)同正常對照組相比,空腹血糖(FPG)、餐后2小時血糖(2hPG)和糖化血紅蛋白(HbA1c)在糖尿病前期和T2D組中呈現(xiàn)顯著性遞增(P<0.0001)。(2)miRNA芯片分析結(jié)果發(fā)現(xiàn):在健康對照組、T2
4、D和糖尿病前期中, hsa-miRNA-1249( hsa-miR-1249)、hsa-miR-320b和hsa-miR-6069呈遞減式下調(diào),而hsa-miR-572在T2D、糖尿病前期和健康對照組中遞減式下調(diào)。(3)通過qRT-PCR驗證顯示:hsa-miR-1249在健康對照組、T2D和糖尿病前期中呈遞減式下調(diào),hsa-miR-320b在健康對照組、糖尿病前期和T2D中呈遞減式下調(diào),hsa-miR-572在T2D、糖尿病前期和健康
5、對照組中遞減式下調(diào),而hsa-miR-6069未得到驗證。qRT-PCR驗證結(jié)果與芯片結(jié)果基本一致。(4)hsa-miR-1249預(yù)測到相應(yīng)靶基因18個,hsa-miR-572找到29個,hsa-miR-320b找到915個,GO和KEGG通路分析得到這些靶基因主要與多細胞有機體的發(fā)展、信號轉(zhuǎn)導、細胞分化、凋亡、離子轉(zhuǎn)運、細胞代謝過程調(diào)控等生物學功能相關(guān)。(5)對于區(qū)分T2D和正常對照組, hsa-miR-1249、hsa-miR-32
6、0b和hsa-miR-572的AUC值分別為0.784(95%CI:0.685~0.883)、0.946(95%CI:0.906~0.985)和0.843(95%CI:0.766~0.920),而對于區(qū)分糖尿病前期和正常對照組,hsa-miR-1249、hsa-miR-320b和hsa-miR-572的AUC值分別為0.887(95%CI:0.818~0.957)、0.635(95%CI:0.525~0.744)和0.69(95%CI:
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