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文檔簡介
1、目的:研究造血干細胞移植HLA匹配供者與受者的19個STR位點(CSF1PO、D21S11、D2S1338、D3S1358、D5S818、D6S1043、D7S820、D8S1179、D12S391、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、FGA、Penta D、Penta E、TH01、TPOX、vWA)多態(tài)性的相似度從而評估造血干細胞供者是否潛在引發(fā)疾病的風險。
方法:從大連市血液中心2011至201
2、4年造血干細胞捐獻者中選取HLA匹配者(HLA-A,HLA-B,HLA-DR完全相同)血樣72對,共144例,為匹配組。選取與匹配組HLA不匹配者(HLA-A,HLA-B,HLA-DR完全不相同)血樣72例,與匹配組72對血樣分別配對,形成144組不匹配組。HLA檢測結(jié)果由大連市血液中心提供。提取DNA并利用毛細管電泳技術對19個特定STR基因座位進行檢測,利用熒光標記引物對19個基因座實施擴增。用FAM來標記D21S11、D5S818
3、、D6S1043D18S51、D19S433,共5個基因座;用HEX來標記CSF1PO、D3S1358、D7S820、D13S317、D16S539、Penta D,共6個基因座;用TMR來標記D8S1179、ETPOX、Penta、vWA,共4個基因座;用CAL Fluor Red610來標記D12S391、D2S1338、FGA、TH01,共4個基因座。同時擴增樣本中的所有DNA片段,用遺傳分析儀、DNA測序儀進行電泳的分析。采用統(tǒng)
4、計學軟件SPSS11.5,分析所得數(shù)據(jù)。利用X2檢驗對STR的位點基因頻率進行分析,并計算匹配組與不匹配組每個基因座位匹配度的顯著性差異是否存在(P<0.05代表有統(tǒng)計學意義)。利用配對樣本T檢驗計算匹配組與不匹配組之間STR總體是否存在顯著性差異(P<0.05代表有統(tǒng)計學意義)。
結(jié)果:經(jīng)X2檢驗匹配組基因頻率,D5S818“基因座”P=0.048、TH01“基因座”P=0.015,P<0.05,有顯著性差異。匹配組與不匹配
5、組的基因頻率,D13S317“基因座位”P=0.041、D16S539“基因座位”P=0.028,P<0.05,有顯著性差異。在配對實驗中匹配組基因座位D19S433、D2S1338、vWA、FGA、D5S818、TH01、CSF1PO、D18S51、D12S391、D16S539、D6S1043、D21S11、D13S317、D7S820配對比率均高于不匹配組,19個基因座位STR極端配對數(shù)明顯高于不匹配組(P=0.006),但如果將
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