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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:探討江蘇淮安地區(qū)食管鱗狀細(xì)胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中miRNA-133a的表達(dá)特征并對(duì)其生物信息學(xué)進(jìn)行分析研究。
方法:采用Microarray流體芯片技術(shù)及熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitatie realtimePolymerase Chain Reaction,qPCR)技術(shù)檢測(cè)食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)癌組織及癌旁組織中miRNA-133a表達(dá);通
2、過miRBase、NCBI、UCSC Browser等在線工具分析miRNA-133a序列特征;應(yīng)用miRanda、TargetScan預(yù)測(cè)miRNA-133a的靶基因,并結(jié)合已證實(shí)的靶標(biāo)基因,進(jìn)行功能富集分析(Gene Ontology)和信號(hào)通路富集分析(Pathway Enrichment),并采用Western Blot技術(shù)檢測(cè)miRNA-133a過表達(dá)/沉默后ESCC細(xì)胞中靶基因蛋白表達(dá)水平。
結(jié)果:1.流體芯片技術(shù)
3、及qRT-PCR技術(shù)檢測(cè)的結(jié)果均表明:淮安地區(qū)食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)癌組織中miRNA-133a表達(dá)水平顯著低于癌旁組織(P<0.05);2.伴淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)的miRNA-133a表達(dá)水平低于無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移組(P<0.05);3.食管鱗癌細(xì)胞株(KYSE-150、ECA109)中miRNA-133a的表達(dá)比正常食管上皮細(xì)胞株Het-1A顯著降低(P<0.05),但食管鱗癌細(xì)胞株高分化和低分化組間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P
4、>0.05);4.miRNA-133a在各物種之間具有高度保守性,其靶基因功能分別富集于蛋白質(zhì)修飾、細(xì)胞增殖及凋亡等生物學(xué)過程(P<0.001),涉及腫瘤、細(xì)胞凋亡等信號(hào)通路(P<0.05);5.參與腫瘤轉(zhuǎn)移相關(guān)的基因血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子A(vascular endothelialgrowth factor A,VEGFA)可能為miRNA-133a的靶基因。
結(jié)論:1.淮安地區(qū)食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)癌組織中hsa-miRNA
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