鐵皮石斛基于trnT-L序列的鑒別與三核苷酸SSR的開發(fā)應(yīng)用.pdf

1、鐵皮石斛(DendrobiumofficinaleKimuraetMigo)是我國蘭科(Orchidaceae)石斛屬(Dendrobium)的珍稀瀕危特有種,為中國植物紅皮書和中國物種紅色名錄中的“極?！狈N,具有“養(yǎng)陰生津、潤喉護(hù)嗓、溫胃明目、補腎益力、延年益壽”等功效。
　　 本研究對17種石斛屬植物的葉綠體基因組trnT-L非編碼區(qū)進(jìn)行了測定,利用分子進(jìn)化遺傳分析軟件MEGA4.0對測得的序列及GenBank上已經(jīng)發(fā)表的2

2、種石斛的trnT-L區(qū)進(jìn)行了比較分析。19種石斛樣品(不包括外類群)的變異位點216個,簡約信息位點93個,特異位點118個,轉(zhuǎn)換與顛換之比為0.35。以Kimura-2參數(shù)計算遺傳距離,19種石斛種間遺傳距離為0.001-0.166。不同石斛種間均存在序列差異,可以把trnT-L與rDNAITS序列相結(jié)合作為鐵皮石斛DNA條形碼的一種補充,應(yīng)用于鑒別研究。
　　 本研究還運用磁珠富集法對鐵皮石斛的微衛(wèi)星進(jìn)行了開發(fā)。共成功開發(fā)出

3、80條微衛(wèi)星序列,并對其中的25條設(shè)計了微衛(wèi)星引物。經(jīng)過聚丙烯酰胺凝膠檢測共開發(fā)出15條具有多態(tài)性的三核苷酸重復(fù)單元的微衛(wèi)星序列。對永嘉居群和福武居群的40個樣本進(jìn)行了多態(tài)性分析,結(jié)果顯示永嘉居群單個位點的等位基因數(shù)從3到8不等,福武居群單個位點的等位基因數(shù)從3到9。利用POPGENE32,計算出永嘉居群期望雜合度從0.629到0.846平均值為0.757,福武居群的從0.646到0.848平均值為0.800。2個居群共有4個位點偏離哈