基于數(shù)據(jù)融合的生物網(wǎng)絡(luò)推斷.pdf

1、科技迅速發(fā)展產(chǎn)生大量不同類型的生物數(shù)據(jù)。每種數(shù)據(jù)從不同的角度，提供獨(dú)立且互補(bǔ)的信息。通過(guò)數(shù)據(jù)融合技術(shù)，可以構(gòu)建復(fù)雜的生物網(wǎng)絡(luò)。其中，蛋白質(zhì)間相互作用網(wǎng)絡(luò)和疾病與基因關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)是后基因組時(shí)代兩個(gè)研究的焦點(diǎn)。蛋白質(zhì)間相互作用網(wǎng)絡(luò)對(duì)理解蛋白質(zhì)功能有著重要的作用，而隨著精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃的推進(jìn)，疾病與基因關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建也變得日益重要。本文針對(duì)這兩個(gè)問(wèn)題提出相應(yīng)的數(shù)據(jù)融合方法。
　　針對(duì)“親和純化-質(zhì)譜”技術(shù)得到的結(jié)果進(jìn)行融合的問(wèn)題，本文提出基于排

2、序整合與錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率控制的Reinforce方法。在每個(gè)排序結(jié)果均是隨機(jī)產(chǎn)生的空假設(shè)下，Reinforce方法通過(guò)三個(gè)步驟對(duì)多個(gè)來(lái)源不同的原始結(jié)果進(jìn)行融合。首先，數(shù)據(jù)預(yù)處理步驟解決數(shù)據(jù)偏差的問(wèn)題。其次，排序整合步驟使得整合后的結(jié)果更加穩(wěn)定。最后，Reinforce方法對(duì)整合結(jié)果進(jìn)行錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率控制，從而得到高質(zhì)量的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，Reinforce方法能夠得到比單組數(shù)據(jù)更穩(wěn)定準(zhǔn)確的結(jié)果。
　　針對(duì)疾病與基因關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)的