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文檔簡介
1、為了研究生物進化,Eigen (1971)引入了一個關(guān)于分子進化的動態(tài)理論-準生物種群模型。在這一模型中,有兩個概念非常重要。一個是適應(yīng)值結(jié)構(gòu),另一個是錯誤閾??偟膩碚f,適應(yīng)值結(jié)構(gòu)是指一個映射f:C→R,它給每-個C中的構(gòu)型賦一個實數(shù)值。這個實數(shù)值可以被看作是這一構(gòu)型適應(yīng)能力的度量。所謂錯誤閾是指人群中能夠保持遺傳信息的最小的復制準確度。如果復制過程中的保真度高于這一錯誤閾,那么經(jīng)過若干代的進化后,個體就會分布在主序列的周圍(每一個個體
2、都是一個0-1序列);否則,個體就可能分散在序列空間中。為了說明準生物種群模型,本文將引入復制刪除過程。這一過程可以描述如下:首先我們假定一個人群。在進化的每一步,先從人群中選擇-個個體,選擇每個個體的概率與個體的適應(yīng)值成比例。然后這一個體自我復制,并允許其在每個位置依概率p發(fā)生變異。將最終得到的序列替換在剩下的人群中隨機選擇的個體。這樣,人群的個數(shù)保持不變。然后我們編程模擬這一過程,用所得數(shù)據(jù)畫圖,從而我們就可以看出最終個體的分布情況
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