有氧運(yùn)動(dòng)干預(yù)高脂膳食大鼠生精細(xì)胞凋亡miRNA的研究.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?
  探討mi RNA對(duì)高脂膳食誘導(dǎo)的肥胖大鼠生精細(xì)胞凋亡的調(diào)控,并初步揭示有氧運(yùn)動(dòng)對(duì)雄性高脂膳食大鼠生精細(xì)胞凋亡的mi RNA干預(yù)作用。
  實(shí)驗(yàn)方法:
  將48只雄性健康SD大鼠隨機(jī)分為4組:普通膳食對(duì)照組(A)、高脂膳食組(B)、普通膳食+運(yùn)動(dòng)組(C)、高脂膳食+運(yùn)動(dòng)組(D),每組各12只;A組和C組,普通飼料喂養(yǎng);B組和D組,高脂、高熱量飼料喂養(yǎng)。C組及D組大鼠進(jìn)行10周60min無(wú)負(fù)重游泳運(yùn)動(dòng),每

2、周6天。實(shí)驗(yàn)結(jié)束后,各組大鼠數(shù)量為A組8只,B組11只,C組10只,D組11,測(cè)量大鼠體重及睪周脂重。將A組大鼠分為A01、A02、A03三組;B組大鼠分為B01、B02、B03三組;C組大鼠分為C01、C02、C03三組;D組大鼠分為D01、D02、D03三組,對(duì)其進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建,共構(gòu)建12組c DNA文庫(kù),利用Solexa高通量測(cè)序技術(shù)結(jié)合生物信息分析鑒定mi RNA并進(jìn)行差異表達(dá)譜的分析,進(jìn)一步選擇部分差異mi RNA,分析其生物學(xué)

3、功能。
  實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
  1.通過(guò)Solexa測(cè)序技術(shù),成功構(gòu)建了大鼠的基因文庫(kù),經(jīng)檢測(cè)得到每組高質(zhì)量的純凈序列(Clean Data)均大于20M,均占原始數(shù)據(jù)87%以上,Q30均在95%以上。對(duì)文庫(kù)中的純凈序列進(jìn)行了分類(lèi)注釋?zhuān)@得包含mi RNA的Unannotated reads。并將小RNA的純凈序列定位到大鼠的基因組,以備后續(xù)的研究。
  2.通過(guò)生物學(xué)分析,從A組、B組、C組、D組四組睪丸組織中共鑒定出4

4、64個(gè)mi RNA,其中315個(gè)為已知mi RNA和149個(gè)為新的mi RNA。根據(jù)|log2(FC)|≥1進(jìn)行文庫(kù)測(cè)序的mi RNA差異表達(dá)分析顯示:B組對(duì)A組差異表達(dá)顯著mi RNA有27個(gè),其中3個(gè)上調(diào),24個(gè)下調(diào)。C組對(duì)A組差異表達(dá)mi RNA有11個(gè),其中0個(gè)上調(diào),11個(gè)下調(diào)。D組對(duì)A組差異表達(dá)mi RNA有62個(gè),其中37個(gè)上調(diào),25個(gè)下調(diào)。
  3.根據(jù)|log2(FC)|≥1重點(diǎn)分析A與B組mi RNA的表達(dá)差異,

5、B組對(duì)A組差異表達(dá)mi RNA有27個(gè),其中3個(gè)上調(diào),24個(gè)下調(diào),共預(yù)測(cè)到19612個(gè)靶基因,其中24個(gè)下調(diào)mi RNAs為:rno-miR-101a-5p,57個(gè);rno-miR-101a-3p,4個(gè);mo-miR-135b-3p,465個(gè)等;3個(gè)上調(diào)mi RNAs:mo-miR-130b-5p,164個(gè);rno-miR-346,2963個(gè);unconservative_6_3922464,3220個(gè)。
  4.GO分類(lèi)可知,對(duì)

6、照組A組和高脂膳食組B組存在差異的mi RNA基因,其對(duì)應(yīng)的靶基因在代謝方面、生殖方面、細(xì)胞死亡、免疫系統(tǒng)等方面均有所表達(dá);在KEGG通路中分類(lèi)可知,差異表達(dá)mi RNA靶基因在Pathways in cancer、MAPK signaling pathway、Wntsignaling pathway、Axonguidance、Apoptosis等方面均表達(dá)。
  5.通過(guò)與NR、Swiss-Prot、Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),獲得與有

7、性生殖有關(guān)的mi RNA有:rno-miR-6328;rno-miR-196b-5p;rno-miR-346;unconservative_6_3922464;mo-miR-503-5p。與細(xì)胞凋亡有關(guān)的mi RNA有:mo-miR-6328;mo-miR-3075;rno-miR-346;rno-miR-130b-5p;rno-miR-205;rno-miR-31a-5p;rno-miR-503-5p;unconservative_1

8、_540112;unconservative_6_3922464。進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),以上mi RNA通過(guò)Bcl、Bax兩個(gè)途徑進(jìn)行生精細(xì)胞凋亡的。
  結(jié)論:
  1.本實(shí)驗(yàn)通過(guò)高通量測(cè)序方法成功獲得普通膳食大鼠、高脂膳食大鼠、普通運(yùn)動(dòng)組和高脂運(yùn)動(dòng)組睪丸的mi RNA的c DNA文庫(kù)。首次對(duì)大鼠睪丸組織進(jìn)行了micro RNA組學(xué)分析,共鑒定出464個(gè)mi RNA,其中315個(gè)為已知mi RNA和149個(gè)為新的mi RNA。

9、>  2.較多的miRNA在高脂膳食的大鼠睪丸中呈下調(diào)趨勢(shì),進(jìn)行有氧干預(yù)后,普通組較多的mi RNA呈上調(diào),總之,差異的miRNA,都在有氧運(yùn)動(dòng)后發(fā)生表達(dá)量的改變,使其生物學(xué)功能發(fā)生改變。
  3.通過(guò)GO、KEGG通路中分類(lèi)可知,對(duì)照組A組和高脂膳食組B組差異的miRNA基因,與有性生殖、細(xì)胞死亡等有關(guān)。
  4.通過(guò)與NR、Swiss-Prot、Pfam數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),我們認(rèn)為高脂膳食引起肥胖的大鼠生殖細(xì)胞通過(guò)Bcl、Bax

10、途徑凋亡有關(guān)的miRNA有:rno-miR-6328; rno-miR-3075;rno-miR-130b-5p;rno-miR-346;rno-miR-503-5p;rno-miR-205;rno-miR-31a-5p;unconservative_6_3922464;unconservative_1_540112;與有性生殖有關(guān)的miRNA有:unconservative_6_3922464;rno-miR-196b-5p;rno-

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