樹麻雀的遺傳多樣性分析及亞種分化的初步研究.pdf

1、樹麻雀(Passer montanus)在自然界的分布極為廣泛，適應(yīng)性較強(qiáng)，與人類的關(guān)系較為密切。自20世紀(jì)80年代以來，我國對(duì)于樹麻雀的研究較少，用分子生物學(xué)方法對(duì)其的研究幾乎是空白。本文對(duì)樹麻雀的遺傳多樣性及亞種分化進(jìn)行初步研究，期望為其研究提供基礎(chǔ)資料。 論文包括兩個(gè)部分，第一部分通過測(cè)定河北省62只樹麻雀線粒體DNA D-loop基因的部分序列，分析河北省樹麻雀的遺傳多樣性；第二部分通過測(cè)定來自我國四個(gè)地區(qū)的15只樹麻雀

2、線粒體Cyt b基因全序列，初步研究我國樹麻雀部分亞種的分化情況。主要結(jié)論如下： 1、線粒體DNA D-loop基因序列平均長度為741bp，所有序列平均A+T含量為57％，G+C含量為43％，A+T含量高于G+C含量。共檢測(cè)到32個(gè)變異位點(diǎn)，占4.44％，其中簡約信息位點(diǎn)6個(gè)，單核苷酸變異位點(diǎn)26個(gè)。 2、運(yùn)用MEGA軟件分析樹麻雀線粒體DNA D-loop基因，結(jié)果為核苷酸多樣性(Pi)為0.0021±0.0004；

3、單倍型多樣性(h)為0.755±0.057。在32個(gè)變異位點(diǎn)中，共統(tǒng)計(jì)到22個(gè)單倍型。單倍型的系統(tǒng)發(fā)生樹結(jié)果表明，河北省樹麻雀種群沒有發(fā)生進(jìn)化分歧現(xiàn)象。 3、核苷酸錯(cuò)配曲線呈現(xiàn)單峰泊松分布；Fu's Fs檢驗(yàn)呈現(xiàn)偏離中性突變，綜合這兩個(gè)結(jié)果可以推測(cè)出樹麻雀種群歷史上曾發(fā)生過擴(kuò)張現(xiàn)象。 4、線粒體Cyt b基因全序列長度為1143bp。所有序列平均堿基組成腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)分別為27.

4、0％、22.9％、14.8％和35.3％。嘧啶(T+C)的含量為58.2％，嘌呤(A+G)含量為41.8％，嘧啶含量高于嘌呤含量。同義密碼子的使用存在著很大偏倚。 5、所有線粒體Cyt b基因全序列共統(tǒng)計(jì)到9個(gè)缺失/插入位點(diǎn)，1110個(gè)保守位點(diǎn)、24變異位點(diǎn)、7個(gè)簡約信息位點(diǎn)、17個(gè)單核苷酸變異位點(diǎn)。轉(zhuǎn)換頻率高于顛換頻率，R值為2.0。其中，密碼子第一、二位點(diǎn)核苷酸替換頻率較低，遠(yuǎn)遠(yuǎn)未達(dá)到飽和；第三位點(diǎn)達(dá)到飽和。 6、采