樹麻雀的遺傳多樣性分析及亞種分化的初步研究.pdf

1、樹麻雀(Passer montanus)在自然界的分布極為廣泛，適應(yīng)性較強，與人類的關(guān)系較為密切。自20世紀80年代以來，我國對于樹麻雀的研究較少，用分子生物學方法對其的研究幾乎是空白。本文對樹麻雀的遺傳多樣性及亞種分化進行初步研究，期望為其研究提供基礎(chǔ)資料。 論文包括兩個部分，第一部分通過測定河北省62只樹麻雀線粒體DNA D-loop基因的部分序列，分析河北省樹麻雀的遺傳多樣性；第二部分通過測定來自我國四個地區(qū)的15只樹麻雀

2、線粒體Cyt b基因全序列，初步研究我國樹麻雀部分亞種的分化情況。主要結(jié)論如下： 1、線粒體DNA D-loop基因序列平均長度為741bp，所有序列平均A+T含量為57％，G+C含量為43％，A+T含量高于G+C含量。共檢測到32個變異位點，占4.44％，其中簡約信息位點6個，單核苷酸變異位點26個。 2、運用MEGA軟件分析樹麻雀線粒體DNA D-loop基因，結(jié)果為核苷酸多樣性(Pi)為0.0021±0.0004；

3、單倍型多樣性(h)為0.755±0.057。在32個變異位點中，共統(tǒng)計到22個單倍型。單倍型的系統(tǒng)發(fā)生樹結(jié)果表明，河北省樹麻雀種群沒有發(fā)生進化分歧現(xiàn)象。 3、核苷酸錯配曲線呈現(xiàn)單峰泊松分布；Fu's Fs檢驗呈現(xiàn)偏離中性突變，綜合這兩個結(jié)果可以推測出樹麻雀種群歷史上曾發(fā)生過擴張現(xiàn)象。 4、線粒體Cyt b基因全序列長度為1143bp。所有序列平均堿基組成腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鳥嘌呤(G)、胞嘧啶(C)分別為27.

4、0％、22.9％、14.8％和35.3％。嘧啶(T+C)的含量為58.2％，嘌呤(A+G)含量為41.8％，嘧啶含量高于嘌呤含量。同義密碼子的使用存在著很大偏倚。 5、所有線粒體Cyt b基因全序列共統(tǒng)計到9個缺失/插入位點，1110個保守位點、24變異位點、7個簡約信息位點、17個單核苷酸變異位點。轉(zhuǎn)換頻率高于顛換頻率，R值為2.0。其中，密碼子第一、二位點核苷酸替換頻率較低，遠遠未達到飽和；第三位點達到飽和。 6、采