細(xì)菌和古細(xì)菌基因組的核心詞理論及其應(yīng)用.pdf

1、分婁號 。! j 6 8 S ‘j K密級 ⑧學(xué)校代瑪：1 0 0 5 5學(xué) 號70 3 D 0 6 9尚糊大茅 N a n k a i U n i V e r s i t v論文題目：細(xì)菌和古細(xì)菌基因組的核心詞理論及其應(yīng)用九，、—^ p ／L 一磁碩士學(xué)位i 侖文M A S T E R ’S D j S S E R T A T I O N培養(yǎng)院系：一級學(xué)科：二級學(xué)科：論文作者：指導(dǎo)教師：數(shù)學(xué)科學(xué)學(xué)院概率論與數(shù)理統(tǒng)計生物信息學(xué)李彥娟沈世

2、鎰教授南開大學(xué)研究生院2 0 0 6 年5 月A b s t r a c tA s t h ea c c o m p l i 8 h i n go ft h e H u m a n G e n o m e P r o j e c t ( H G P ) ，M i c r o b i a lG e n o m eP r o g r a m ( M G P ) i sb e i n g c a r r i e do u tr a p i d

3、 l yi nt h ew h o l ew o r l d ，a n db a c t e r mg en o m i cr e s e a r c h e ss p e e du pt h ef i n d i n go f l 【e y p a t h o g e n i cg e n e s ． A sa ni m p o r t a 皿tb r a n c ho fM i c o b i 出G e n o m i c s ，B

4、 a c t e r i aG e n o m i c 8w o u l d b e c o m et ot h eh o t 8 p o ti na 】o n gt j m e ． B a s i n go nt h es 鋤齜1 t i c 鋤a l y 幽t h e o r yw 1 1 i c h i sp r o p o s e db yP r o fS h e nS h i y i ，t h i sp a p e rt a

5、k e s2 8 0D N A 8 e q u e n c e so fb a c t e r i aa st h eo r i 舀n a ld a t a ，m a i n l y 池c 1 1 s s e st h ek e r n e lw o r dt h e o r y ．T h e k e r n e lw o r di st h ev e c t o ra ( “) w h i c ha p p e 盯8o n l yo

6、n c ei n t h es e q u e n c eb u tn _ 一1 ) a p p e a 船m o r et h 舡lo n c e ． T h e m a i nr e s u l t so ft h i sp a p e ri n c l u d i n g ：( 1 ) t h ef a s t 越g o r i t h mo fr e s e a r 出i n gk e r n e lw o r di ng e

7、n o m e s ；( 2 ) t h e k e r n e lw o r d d a t a b a s e o ft h e 2 8 0 D N A s e q u e n c e s a n dt h e i r s t a t j s t i c a lr e s u l t s ；( 3 ) e n u m e r a t i n gs e v e r a la p p l i c a t i o l l 8o ft h

8、e k e r n e lw o r dd a t a b a s e ，i n d u d i n gt h er e s e a r c ha n d a l i g n m e n to fk e y w o r d ，k e r n e lw o r da n d g e n ek e r n e lw o r d ，e t c ．K e y w o r d s ： S e m a n t i ca n a l y s i s