細(xì)菌基因組中脂類代謝的比較.pdf

1、脂類是生物體內(nèi)一大類重要的有機(jī)化合物，行使重要的生物學(xué)功能。但是長期以來，人們對脂類代謝的研究主要集中在動物，所用方法也多是實(shí)驗(yàn)方法，而對于細(xì)菌脂類代謝的研究相對較少，且研究也大多局限于對單個(gè)細(xì)菌的脂類合成與分解的某個(gè)蛋白或基因的分析。針對這一問題，我們采用基因組分析的方法，統(tǒng)計(jì)比較了不同類型細(xì)菌基因組中脂類代謝相關(guān)酶的差異。由于在國際公共數(shù)據(jù)庫中已有的基因組注釋信息依然存在很多問題，我們首先對選取細(xì)菌的基因組進(jìn)行了重新注釋；將重新注釋

2、過的131種細(xì)菌按照革蘭氏屬性、最適生長溫度和對氧氣需求的不同進(jìn)行分類。從基因的水平上，統(tǒng)計(jì)每種脂類代謝相關(guān)酶在不同類型細(xì)菌中的分布，比較不同類型細(xì)菌脂類代謝的差異，并對差異做進(jìn)一步討論與分析。
　　通過對細(xì)菌基因組中脂類代謝相關(guān)酶的統(tǒng)計(jì)分析，發(fā)現(xiàn)不同類型的細(xì)菌脂類代謝主要存在以下差異：
　　（1）厭氧細(xì)菌主要通過不飽和脂肪酸鏈的延伸合成不飽和脂肪酸，而好氧細(xì)菌主要通過長鏈脂肪酸的脫氫合成不飽和脂肪酸；
　?。?）不飽

3、和脂肪酸合成酶主要存在于低溫和中溫細(xì)菌中，在高溫細(xì)菌中很少存在；
　　（3）負(fù)責(zé)起始脂肪酸合成和初期脂肪酸鏈延長的3-酮?；?ACP合成酶III在細(xì)菌中廣泛存在，而在高溫細(xì)菌中主要通過3-酮酰基-ACP合成酶II負(fù)責(zé)后續(xù)脂肪酸鏈的延長，在中溫和低溫細(xì)菌中主要通過3-酮酰基-ACP合成酶 I負(fù)責(zé)后續(xù)脂肪酸鏈的延長；
　?。?）革蘭氏陽性細(xì)菌也可以通過存在于哺乳動物中的甲羥戊酸途徑來合成異戊烯焦磷酸；
　?。?）細(xì)菌主要通