截型苜蓿生物數(shù)據(jù)分析平臺的構(gòu)建和耐鹽相關(guān)基因的預(yù)測與驗(yàn)證.pdf_第1頁
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1、Y938327分類號搟級單位代碼:10019學(xué)號:s030900飛蛾囊弋式等’碩士學(xué)位論文截型苜蓿生物數(shù)據(jù)分析平臺的構(gòu)建和耐鹽相關(guān)基因的預(yù)測與驗(yàn)證Medicagotrunct鋤ulaBioDataAnalysisPlatformConsmlctionandSalttoleranceRelativeGenesPredictionandValidation研究生:趔亟釜指導(dǎo)教師:王洼數(shù)援——合作指導(dǎo)教師:繭震教援申請學(xué)位門類級別:理堂亟號業(yè)

2、名稱:生物絲堂生盆王生物堂研究方同:植物遺佳工程所在學(xué)院:生物堂院2006年6月AbstractThesmalldiploidgenome,selfpollinated,fastgenerationtimeandeaseoftransformationmakeMtruncatulaasagoodmodelplantforlegumegeneticsgenomicsSalinesoildistributewidelyinpasturing

3、areainchina,Studyingthemolecularmechanismsunderlyingsalt—stressenvironmentbenefittoincreaseagriculturalyield,improvesoilqualityandunderstandgeneregulation,signaltransduction,iontransponandmineralnutritioninstressenvironm

4、entsSequencingisunderwaytherearelargenumbersofESTswhicharedifficulttouseeffectivelyandlittlewebresourcesforMf,uncatulainChinaTobetterusingMtruncatulaESTsdataandotherpublicresources,facilitateinformationcommunicationandsh

5、aring,accuratestudyingspeedforkeygenesrespondingtosaltstress,weconstructaMtruncatulabio—dataanalysisplatform,called‘MedicagoTruncatulaHome”,whichintegratesMTClone,ainsilicoclonesystemspeciallyforMtruncatula,andlarge—scal

6、epredictMtruncatulagenesrelativetosalt—toleranceusingpublicresourceandMicroarraydataWehavecompletedfunctionsinbasicinformationsearch,MTClone,TCclassifyandpredictedgenesearchOurdatabasecontains36,878TC,201,653EST,650predi

7、ctedgenesrelativetosaltstress,514ArabidopsisgenesandrelatedpublicationsWeclassify650TCto7subsetsaccordingtodifferenceinrespondingtosaltstressTodeterminethevalidityoftheinsilicoanalysis,9TCwasselectedfrom3subsetstodomolec

8、ularexperimentNowWehavegot3cDNAclones,theyareTC94828,TCl06344andTCl01805Furthermore,TC94828wasinsertedintoPET30AandwehavegotprokaryoticexpressionThroughbioinformaticsanalysis,reducevalidationsequencescope,decreaseexperim

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