蛋白質二級結構預測的信息統(tǒng)計迭代比對算法.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、信息統(tǒng)計迭代算法(ISIA)是一種全新的從蛋白質氨基酸序列出發(fā)預測二級結構序列的算法。此算法可以很好的揭示氨基酸序列和二級結構序列之間的內在關系，進而對蛋白質二級結構做出預測。在傳統(tǒng)的貝葉斯方法基礎上，信息統(tǒng)計迭代算法采用了3個不同的閾值去提高預測的準確率。 信息統(tǒng)計迭代比對算法(ISIA-MSA)是在利用多重序列比對的進化信息的基礎上，有機的結合信息統(tǒng)計迭代算法的一種預測蛋白質二級結構的混合型算法。對序列進行比對，并利用序列

2、比對的信息進行結構的預測。在比對的過程中，我們可以找到和未知序列相似的序列家族，然后假設序列家族中的同源區(qū)有同樣的二級結構，預測不是基于一個序列而是一組序列中的所有序列的一致序列。信息統(tǒng)計迭代比對算法(ISIA-MSA)綜合利用了序列的進化信息和統(tǒng)計信息。 以PDBselect數(shù)據庫中的提取的3265條蛋白質肽鏈作為實驗的數(shù)據庫。信息統(tǒng)計迭代算法的預測準確率為Q<,3>：62.5％。而信息統(tǒng)計迭代比對算法的預測結果在經過完整的

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