結(jié)直腸癌GWAS研究發(fā)現(xiàn)的SNPs與316例結(jié)直腸癌TNM分期之間的相關(guān)性研究.pdf

1、目的：選擇在東亞人群中經(jīng)全基因組關(guān)聯(lián)研究（Genome-Wide Association Study, GWAS）發(fā)現(xiàn)的與結(jié)直腸癌（Colorectal Cancer, CRC）遺傳易感性相關(guān)的單核苷酸多態(tài)(Single Nucleotide Polymorphism, SNPs)位點(diǎn)，在CRC患者外周血樣本中重點(diǎn)分析它們與TNM分期之間的關(guān)系，探索影響CRC預(yù)后的潛在分子標(biāo)志物。
　　方法：檢索GWAS數(shù)據(jù)庫(kù)，尋找已發(fā)表的有關(guān)東

2、亞人群的GWAS，并參照我們的前期研究，選定我們的目的SNPs。本研究以2014年2月至2015年12月間于武漢市相關(guān)合作醫(yī)院接受結(jié)直腸癌根治手術(shù)的316例患者為研究對(duì)象，采集其外周血樣本，提取DNA，并系統(tǒng)收集臨床、病理資料和進(jìn)行相關(guān)信息的隨訪。通過(guò)TaqMan基因分型技術(shù)對(duì)選定的SNPs進(jìn)行檢測(cè)。應(yīng)用卡方檢驗(yàn)、t檢驗(yàn)、logistic回歸模型等統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)相關(guān)數(shù)據(jù)進(jìn)一步分析。
　　結(jié)果：我們選定19個(gè)位點(diǎn)和316例CRC患者納

3、入本研究。
　　1：基本信息分析：316例CRC患者的平均年齡是59.73±12.85歲，男性201例（63.6％），女性115例（36.4%）。病例組（T3+T4或N1+N2或M1）和對(duì)照組（T1+T2或N0或M1）在性別、年齡、吸煙史、飲酒史分布無(wú)顯著差異(P>0.05)。
　　2：各位點(diǎn)與CRC的T分期（浸潤(rùn)深度）之間關(guān)系：19個(gè)位點(diǎn)的基因分型在對(duì)照組（ T1+T2）中均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡（ Ha

4、rdy-Weinberg Equilibrium，HWE）法則（P<0.05），經(jīng)病例對(duì)照研究發(fā)現(xiàn)有四個(gè)位點(diǎn)（rs6687758、rs10505477、rs6983267、rs7014346）的SNPs與CRC的T分期相關(guān)。進(jìn)一步各種模型分析發(fā)現(xiàn)：在加性模型中，這種相關(guān)性仍然有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P<0.05）；而顯性模型中，只有rs6687758位點(diǎn)的SNP有意義；在隱性模型中，rs10505477、rs6983267、rs7014346位點(diǎn)

5、的SNPs與T分期有相關(guān)性。
　　3：各位點(diǎn)與CRC的N分期（淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移）之間關(guān)系：19個(gè)位點(diǎn)的基因分型在對(duì)照組（N0）中均符合HWE法則，經(jīng)位點(diǎn)的病例對(duì)照初步分析，并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)其中有與CRC的N分期相關(guān)的SNP。在加性模型、顯性模型分析中，各發(fā)現(xiàn)一個(gè)位點(diǎn)（分別是rs647161和rs6687758）的SNP與CRC的N分期相關(guān);而在隱性模型中，沒(méi)有發(fā)現(xiàn)有意義的位點(diǎn)。
　　4：各位點(diǎn)與CRC的M分期（遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移）之間關(guān)系:有17

6、個(gè)位點(diǎn)的基因分型在對(duì)照組（M0）中符合HWE法則（兩個(gè)位點(diǎn)rs12603526、rs2241714不符合HWE法則，P<0.05）。在位點(diǎn)的病例對(duì)照分析中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)與CRC的M分期相關(guān)的SNP。經(jīng)加性模型、顯性模型及隱性模型進(jìn)一步分析，仍然沒(méi)有發(fā)現(xiàn)相關(guān)的位點(diǎn)。
　　結(jié)論：選定的19個(gè)GWAS發(fā)現(xiàn)的位點(diǎn)中，rs6687758、rs10505477、rs6983267和rs7014346位點(diǎn)的SNPs與CRC的浸潤(rùn)深度相關(guān)；rs6471