小尾寒羊ADPN和IGF1基因多態(tài)性及其遺傳效應分析.pdf

1、本研究以259只鄆城小尾寒羊為研究對象，利用DNA混合池測序方法和直接測序技術檢測小尾寒羊脂聯(lián)素基因(ADPN)的內(nèi)含子2和外顯子3、3'UTR區(qū)多態(tài)性及類胰島素生長因子1(IGFl)基因5'UTR和外顯子2和內(nèi)含子2多態(tài)性;用Codoncode Aligner4.0對測序結果判別純合子和雜合子情況;使用SHEsis軟件分析基因的連鎖不平衡狀態(tài);用Popgen3.2軟件統(tǒng)計基因突變位點的遺傳多態(tài)性;用Molkin3.0計算基因型頻率和群

2、體多態(tài)信息含量(PIC)值等值;用SAS9.0軟件分析基因多態(tài)性與繁殖性狀、體尺體型指數(shù)、血液理化性狀間的關聯(lián)效應。結果表明:
　　 (1)所研究群體中，在ADPN基因內(nèi)含子2和外顯子3部分序列中共檢測到6個SNPs，即10436位的G/A、10454位的A/G、10660位的T/C、10677位的C/T、10732位的C/T和10753位的C/T，均處于H-W平衡狀態(tài)(P＞0.05)，經(jīng)過連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)10436位與106

3、60位處于完全連鎖狀態(tài)，10677位與10753位處于完全連鎖狀態(tài);在IGF1基因外顯子2及內(nèi)含子2檢測到2個SNPs，即4908C/T、4988G/A，其等位基因和基因型頻率均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P＞0.05)。
　　 (2)在與產(chǎn)羔數(shù)關聯(lián)分析中，ADPN基因的10454位點突變對第四胎產(chǎn)羔數(shù)影響達到顯著(P＜0.05)水平;IGF1基因中，4908位點的CT基因型個體第三胎產(chǎn)羔數(shù)極顯著(P＜0.01)多

4、于CC基因型個體，存在極顯著的等位基因替代效應(P＜0.01);4988位點上等位基因A為校正產(chǎn)羔數(shù)的有利等位基因。
　　 (3)在與體尺、體型指數(shù)關聯(lián)分析中，ADPN基因各位點上年齡效應對性狀影響除管圍外均達到顯著(P＜0.05)或者極顯著(P＜0.01)水平，基因型和互作效應對性狀影響均不顯著;IGF1基因兩個位點上年齡對性狀的影響除管圍外均達到顯著(P＜0.05)或者極顯著(P＜0.01)水平，基因型效應不顯著，4988位

5、點互作效應對十字部高、體高和體長指數(shù)影響達到極顯著水平(P＜0.01); IGF1基因4988位點突變對2歲羊群體十字部高和體高影響達到顯著(P＜0.05)水平。等位基因A對l歲羊群體的體長指數(shù)具有負效應。
　　 (4)在與血液理化指標關聯(lián)分析中，ADPN基因六個突變位點對不同年齡段小尾寒羊堿性磷酸酶產(chǎn)生顯著(P＜0.05)或者極顯著(P＜0.01)影響;10732位點突變對甘油三酯5歲羊和全群影響也達到極顯著(P＜0.01)水

6、平。IGF1基因4908位點突變對堿性磷酸酶和總膽固醇以及血紅蛋白含量產(chǎn)生顯著(P＜0.05)或者極顯著(P＜0.01)的影響。
　　 (5) ADPN基因的單倍型效應及其交互作用對部分體尺體型指數(shù)、血液理化性狀產(chǎn)生顯著或者極顯著影響;IGF1基因的單倍型效應及其交互作用對血液理化性狀產(chǎn)生影響。
　　 (6) ADPN與IGF1基因間交互作用對產(chǎn)羔數(shù)、部分體尺性狀和生理生化部分性狀產(chǎn)生影響。
　　 本研發(fā)現(xiàn)ADP