線蟲全基因組內源siRNA及其靶點基因預測與功能分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、RNA干擾現(xiàn)象是近年新發(fā)現(xiàn)的一種自然存在的生物學現(xiàn)象，它由互補雙鏈RNA介導使靶標mRNA降解或抑制翻譯，表型上導致靶mRNA轉錄后沉默，是生物界古老而且進化高度保守的現(xiàn)象之一。在基因功能研究和基因藥物等方面具有廣泛的應用前景，是近年來生物學研究的熱點問題之一。
　　 本文根據(jù)RNA干擾的基本原理，運用生物信息學的原理和方法，通過計算機編程尋找模式生物線蟲mRNA內含子中大量的siRNA，并找到了siRNA相應的靶標基因。統(tǒng)計了

2、這些序列在線蟲基因組中的分布情況，推測存在一個由內源性siRNA參與的基因調控途徑。并在此基礎上，我們構建了本地Gene Ontology(GO)分析系統(tǒng)，進一步對所有產生內源siRNA基因及其靶標基因進行了Gene Ontology(GO)富集度功能分析，發(fā)現(xiàn)內源siRNA基因最顯著的生物過程功能為胚胎發(fā)育(G0:0009792embryonic development)，細胞組成最顯著是整合在細胞膜內(G0:0016021integ

3、ral to membrane)，分子功能則為?；D移酶活性(G0:0008415 acyltransferaseactivity)；其靶標基因最顯著的生物過程功能為染色質修飾(G0:0016568chromatin modification)，(細胞組成最顯著也是整合在細胞膜內(G0:0016021integral to membrane))，分子功能為組蛋白賴氨酸N’甲基轉移酶活性(G0:0018024histone-lysine

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