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文檔簡介
1、隨著新一代高通量測序技術(shù)的迅猛發(fā)展,RNA-Seq技術(shù)已成為目前轉(zhuǎn)錄組研究的重要手段,而轉(zhuǎn)錄組測序深度直接影響表達(dá)基因的檢測。本文基于RNA-Seq測序技術(shù),研究了測序深度對表達(dá)基因檢測的影響,為不同研究目的而選擇合適的測序深度提供了參考。本文以人類腦組織的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)為分析材料,建立了完整的RNA-Seq數(shù)據(jù)分析流程,首先對FASTQ格式的測序數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量評估和過濾處理,然后從過濾后的數(shù)據(jù)中隨機(jī)取樣,模擬構(gòu)建了不同測序深度的文庫,最
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