幾種非編碼RNA三維結(jié)構(gòu)的理論研究.pdf

1、RNA(核糖核酸)在生物系統(tǒng)內(nèi)是比較重要的分子之一,它在生物體內(nèi)執(zhí)行了多種功能。非編碼RNA（noncoding RNA，ncRNA）是指不能翻譯成蛋白的RNA，近些年來它一直是人類基因組學(xué)研究的重點(diǎn)。目前已經(jīng)知道了很多非編碼RNA的一級(jí)信息序列，但是它們的結(jié)構(gòu)尚未清楚，這就限制了對(duì)它們的生物意義的了解。因此，深入研究非編碼RNA并對(duì)它們的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)是非常有必要的，而且有重要意義。
　　為了研究非編碼RNA的三級(jí)結(jié)

2、構(gòu)，我們選取了多個(gè)有代表性的非編碼RNA作為研究對(duì)象，包括端粒酶的CR4/5，H19 RNA，HULC RNA,HOTAIRRNA以及MALAT RNA。端粒酶的CR4/5與蛋白亞基TRBD的相互結(jié)合在大多數(shù)真核動(dòng)物中都普遍存在，為了理解這種相互作用的關(guān)系，本文利用 RNA三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法3dRNA和3dRPC對(duì)CR4/5區(qū)域進(jìn)行了結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和分析，這為進(jìn)一步研究CR4/5區(qū)域結(jié)合前后構(gòu)象變化提供幫助。另一方面已有研究證明，非編碼RNA的

3、表達(dá)異?；蛘咄蛔兒秃芏嗉膊　⒛[瘤有密切的關(guān)系。本文選取了幾個(gè)有代表性的與疾病有關(guān)的非編碼RNA進(jìn)行二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)。這些RNA與疾病的關(guān)系是：H19 RNA可能是致癌因子；HULC RNA可以作為肝癌的特異性標(biāo)志；HOTAIRRNA在腫瘤細(xì)胞中的高表達(dá)會(huì)促進(jìn)腫瘤的惡化；此外，HOTAIR RNA也是乳腺癌的重要指標(biāo)，而且在四大腸癌中的表達(dá)高于正常水平；MALAT RNA和諸多惡性腫瘤都有關(guān)，例如肺癌、子宮內(nèi)膜癌、結(jié)直腸癌等，而且