21種雀形目鳥(niǎo)類細(xì)胞色素b基因序列分析及其系統(tǒng)發(fā)育研究.pdf

1、雀形目鳥(niǎo)類是鳥(niǎo)綱中最大的一個(gè)類群，在自然界中有著廣泛的適應(yīng)輻射，有關(guān)該類群的起源以及各科演化關(guān)系，一直是鳥(niǎo)類學(xué)研究中爭(zhēng)論的主要問(wèn)題之一。在系統(tǒng)學(xué)研究上，由于分子系統(tǒng)學(xué)所具有的優(yōu)勢(shì)，近些年來(lái)，越來(lái)越多的人應(yīng)用分子系統(tǒng)學(xué)的方法進(jìn)行鳥(niǎo)類系統(tǒng)發(fā)育研究。本研究應(yīng)用DNA序列分析的方法，測(cè)定了雀形目21種鳥(niǎo)類線粒體細(xì)胞色素b基因部分序列，并利用軟件對(duì)序列進(jìn)行分析，構(gòu)建了系統(tǒng)樹(shù)，結(jié)果表明： 1.在沼澤山雀(Paruspalustris)中可能

2、存在核內(nèi)線粒體假基因(Numts)，而在灰背鶇(Turdushortulorun)和煤山雀(Parusater)中擴(kuò)增出的異常片段是否為核內(nèi)線粒體假基因還有待進(jìn)一步研究。 2.細(xì)胞色素b基因序列(455bp)的特點(diǎn)：T、C、A、G的平均含量為24.2％、32.2％、28.5％、15.1％，G+C含量為47.3％，密碼子第三位的堿基使用存在嚴(yán)重的偏倚，密碼子第三位堿基傾向于A或C(A+C含量為86.4％)，而第三位堿基是G的概率最

3、小(2.7％)；核苷酸的變異主要是轉(zhuǎn)換和顛換，且轉(zhuǎn)換多于顛換，R平均值為1.5，其中密碼子第一位R=2.3，第二位無(wú)顛換，全是轉(zhuǎn)換，第三位R=1.3；同義密碼子的使用存在偏倚；序列之間的平均遺傳距離為0.176. 3.在科級(jí)系統(tǒng)關(guān)系上，認(rèn)為燕雀類和鹀類的分歧達(dá)到了科級(jí)水平，支持將它們分別歸入燕雀科和鹀科；支持將鹟類、鶇類、長(zhǎng)尾山雀類、鶯類和巖鷚類獨(dú)立成科的觀點(diǎn)；通過(guò)構(gòu)建系統(tǒng)樹(shù)，初步確定了科間的系統(tǒng)關(guān)系：((鹟科，鶇科)，(((長(zhǎng)

4、尾山雀科，鶯科)，山雀科)，(①(巖鷚科，(鹀科，燕雀科)))))其中①也是山雀科可能的位置，有待進(jìn)一步研究。 4.在科下系統(tǒng)關(guān)系上，認(rèn)為應(yīng)在在燕雀科(Fringillidae)下設(shè)一新的亞科-錫嘴雀亞科(Coccothraustinae)，與已有的燕雀亞科和金翅雀亞科平級(jí)。 5.根據(jù)相對(duì)速率檢驗(yàn)，認(rèn)為各主要分支的替代速率相同。并根據(jù)每百萬(wàn)年2％的進(jìn)化速率推斷出了各主要分支的大致分歧時(shí)間：燕雀科與鹀科的分歧時(shí)間在8.0百