紫菜核糖體rDNA基因結(jié)構(gòu)多樣性分析.pdf

1、紫菜是我國(guó)重要的海洋經(jīng)濟(jì)作物,是潮間帶藻類的模式物種。生活史包括大型配子體(葉狀體)世代和微型孢子體(絲狀體)世代,繁殖方式包括無(wú)性繁殖和有性繁殖兩種,這種特殊而又復(fù)雜的生活史使得紫菜在進(jìn)化過(guò)程中具有較高的變異度。
　　核糖體rDNA基因作為一種分子標(biāo)記用于研究種的分類及遺傳多樣性被廣泛接受,但最近研究發(fā)現(xiàn)許多真核生物的rDNA基因結(jié)構(gòu)在種間及種內(nèi)存在變異,甚至在個(gè)體內(nèi)部ITS序列也存在多樣性。這種變異及多態(tài)性對(duì)于正確解釋物種的系

2、統(tǒng)發(fā)生和遺傳結(jié)構(gòu)顯得尤為重要。本研究以條斑紫菜和壇紫菜為研究對(duì)象,對(duì)兩個(gè)物種野生群體和養(yǎng)殖群體的核糖體rDNA在基因結(jié)構(gòu)的多樣性進(jìn)行了分析,取得以下結(jié)果:
　　1.條斑紫菜養(yǎng)殖群體30個(gè)個(gè)體和野生群體27株個(gè)體的18SrDNA均不包含內(nèi)含子序列,ITS序列未呈現(xiàn)明顯的插入/缺失,EcoRV帶型沒(méi)有呈現(xiàn)多樣性,表明所選用的來(lái)自不同品系的個(gè)體間及個(gè)體內(nèi)18SrDNA-ITS-5.8SrDNA基因結(jié)構(gòu)單一。其二級(jí)結(jié)構(gòu)能使18SrRNA的

3、3'端、5.8SrRNA、28SrRNA5'端,三部分成熟端互相靠近,形成一個(gè)核心結(jié)構(gòu)。
　　2.壇紫菜野生群體18SrDNA-ITS-5.8SrDNA在不同個(gè)體間及個(gè)體內(nèi)呈現(xiàn)多態(tài)性,EcoRV帶型亦呈現(xiàn)多態(tài),測(cè)序分析發(fā)現(xiàn),部分個(gè)體18SrDNA含有I型內(nèi)含子結(jié)構(gòu),大小為554bp,插入位點(diǎn)為18SrDNA的1803–1807位,GC含量為51.1％,不同個(gè)體內(nèi)含子片段長(zhǎng)度接近,但序列存在差異。表明18SrDNA協(xié)同進(jìn)化存在差異。

4、而絲狀體不同品系間18SrDNA基因結(jié)構(gòu)多樣性較低,10個(gè)品系的18SrDNA均含有內(nèi)含子結(jié)構(gòu),一個(gè)品系內(nèi)含子丟失。不同品系的ITS1區(qū)域和ITS2區(qū)域序列變異程度差別較大,構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)呈現(xiàn)不同的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。純合絲狀體個(gè)體內(nèi)部ITS序列不同拷貝序列相似度為100%,表明協(xié)同進(jìn)化程度較高。條斑紫菜ITS序列未呈現(xiàn)長(zhǎng)度多態(tài)性,堿基序列存在不同程度變異。
　　本研究結(jié)果將為紫菜的種質(zhì)鑒定及遺傳多樣性分析提供理論支持,也將為了解紫菜屬物