抗凋亡與促凋亡蛋白質(zhì)的高級結(jié)構(gòu)分析及分類預(yù)測.pdf

1、蛋白質(zhì)是組成生物有機體的基本大分子之一，在生物體的生命過程中起著非常重要的作用。蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)決定了蛋白質(zhì)的功能，要對生物學(xué)很多領(lǐng)域進行深入的研究，就需要深入了解蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。凋亡蛋白質(zhì)可以分為抗凋亡蛋白質(zhì)和促凋亡蛋白質(zhì)，它們對細(xì)胞凋亡有著相反的調(diào)控作用。所以對抗凋亡與促凋亡蛋白質(zhì)高級結(jié)構(gòu)的研究，以及基于對高級結(jié)構(gòu)信息的識別，能使我們更好地了解凋亡蛋白質(zhì)是如何發(fā)揮功能的。
　　本文針對SwissProt數(shù)據(jù)庫所建立的數(shù)據(jù)集A-P

2、461中的239條抗凋亡蛋白質(zhì)與222條促凋亡蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)集進行結(jié)構(gòu)域、模體信息的搜索與分析，發(fā)現(xiàn)了抗凋亡蛋白質(zhì)和促凋亡蛋白質(zhì)所特有的結(jié)構(gòu)域和模體結(jié)構(gòu)，也發(fā)現(xiàn)了部分結(jié)構(gòu)域、模體信息是抗凋亡與促凋亡蛋白質(zhì)所共有的。在PDB數(shù)據(jù)庫中找到上述結(jié)構(gòu)域的二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)，再利用MEME搜索序列模體，從而提取出具有凋亡作用的保守的高級結(jié)構(gòu)的特征與信息，這些特征信息可以為抗凋亡與促凋亡作用機制的研究提供幫助。
　　本文還構(gòu)建了每條蛋白質(zhì)都有結(jié)構(gòu)