蝦夷扇貝fosmid文庫構(gòu)建及WGP物理圖譜構(gòu)建策略的初步評估.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、蝦夷扇貝(Patinopectenyessoensis)主產(chǎn)地主要位于日本的北部、俄羅斯遠(yuǎn)東及朝鮮半島北部沿海等區(qū)域。因其品質(zhì)良好,在1982年引進中國后迅速成為我國重要的海洋經(jīng)濟貝類之一,在海水養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)中占據(jù)著極其重要的地位。隨著第二代高通量測序技術(shù)(NGS)的發(fā)展,在基因組水平深入了解一個物種已逐漸變得簡單、快捷、低成本。目前,有關(guān)蝦夷扇貝的基因組學(xué)研究正在深入開展。物理圖譜在輔助基因組序列拼接和功能基因圖位克隆等方面都發(fā)揮著重要作

2、用。為了配合蝦夷扇貝全基因組序列組裝,本研究構(gòu)建了一個覆蓋蝦夷扇貝基因組3.3X的Fosmid文庫,它為蝦夷扇貝物理圖譜的構(gòu)建、基因組測序工作的順利進行、以及遺傳圖譜、物理圖譜的整合奠定基礎(chǔ)。
　　本文還對蝦夷扇貝Fosmid文庫部分克隆,使用序列特異性標(biāo)簽的混合全基因組(Whole genome profiling,WGP)方法進行了蝦夷扇貝物理圖譜構(gòu)建策略的初步探索,確定了以8張384孔板的克隆混合為一個超級池的混池策略,構(gòu)建

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