維生素D受體，白細(xì)胞介素-10基因多態(tài)性與慢性牙周炎和2型糖尿病易感性的關(guān)系.pdf

1、目的: 通過對維生素D受體和IL-10基因單核苷酸多態(tài)性與漢族人群慢性牙周炎和2型糖尿病易感性的關(guān)系的研究，進(jìn)一步探討慢性牙周炎與2型糖尿病的共同遺傳背景。 方法: 收集107例重度慢性牙周炎患者、121名牙周健康對照者、64例單純2型糖尿病患者（VDR基因組為64例，IL-10基因組為68例）及96例2型慢性牙周炎伴2型糖尿病患者的頰粘膜拭子，以Chelex-100法提取DNA，采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度

2、多態(tài)性（PCR-RFLP）方法測定VDR基因BsmⅠ、ApaⅠ、TaqⅠ、FokⅠ位點(diǎn)和IL-10基因-1082G/A、-819C/T、-592C/A位點(diǎn)的基因型，分析各疾病組與對照組間基因型、等位基因頻率和單倍體頻率分布的差異。 結(jié)果: 1.VDR BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠSNPs檢測結(jié)果及Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn) VDR BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠ各位點(diǎn)PCR產(chǎn)物經(jīng)相應(yīng)

3、的限制性內(nèi)切酶酶切后讀取基因型。隨機(jī)抽取10%的樣本，重復(fù)檢測基因型結(jié)果與前完全一致。各位點(diǎn)基因型經(jīng)PCR產(chǎn)物測序證實(shí)與前完全一致。四組資料的基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律（p>0.05）。 2.VDR基因型和等位基因在不同組別分布頻率比較 VDR基因BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠ位點(diǎn)基因型和等位基因分布頻率在四組間差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P>0.05）。其中，TaqⅠ位點(diǎn)在四組受檢者中基因

4、型分布均以TT純合子為主，Tt雜合子較少，tt純合子分別在CP組和DM組中各有一例。BsmⅠ位點(diǎn)在四組受檢者中均未發(fā)現(xiàn)BB基因型，以bb純合子占較大比例，Bb雜合子較少。 對四組資料進(jìn)行性別分層統(tǒng)計(jì)，結(jié)果顯示，VDR基因BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠ位點(diǎn)基因型和等位基因分布頻率在四組間差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P>0.05）。 3.VDR基因各位點(diǎn)間在不同組別的連鎖不平衡分析 在2型糖尿病組和健康對照組中Bsm

5、Ⅰ和TaqⅠ位點(diǎn)間、在牙周炎伴2型糖尿病組和健康對照組中BsmⅠ和ApaⅠ位點(diǎn)間均存在較強(qiáng)的連鎖不平衡（D'>0.5）。 4.VDR基因BsmⅠ、TaqⅠ和ApaⅠ位點(diǎn)間在不同組別的單倍體型分析 在慢性牙周炎組和健康對照組中，單倍體BTA的頻率分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，X2=4.219，P＝0.040，OR值為4.066，95%CI=0.960～17.231。在2型糖尿病組和健康對照組中，單倍體Bta的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

6、單倍體btA僅在對照組中出現(xiàn)，且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。在牙周炎伴2型糖尿病組和健康對照組中，單倍體btA亦僅在對照組中出現(xiàn)，且差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。在后兩組中其總的P值均<0.05。 5.IL-10-1082 G/A、-819 C/T和-592 C/A SNP檢測結(jié)果及Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn) IL-10-1082 G/A、-819 C/T和-592 C/A各位點(diǎn)PCR產(chǎn)物經(jīng)相應(yīng)的限制性內(nèi)切酶酶切后讀取基因型。隨機(jī)

7、抽取10%的樣本，重復(fù)檢測基因型結(jié)果與前完全一致。各位點(diǎn)基因型經(jīng)PCR產(chǎn)物測序證實(shí)與前完全一致。四組資料的基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律（p>0.05）。 6.IL-10基因型和等位基因在不同組別分布頻率比較 IL-10基因啟動子區(qū)-592 C/A位點(diǎn)基因型分布在四組間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（X2=9.505，P=0.147），等位基因頻率在四組間比較有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（X2=8.620，P=0.035），進(jìn)一

8、步兩兩比較，DP組與對照組間，等位基因頻率分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（X2=5.742，P=0.017），A等位基因相對于C等位基因OR（95%CI）：=1.692（1.098～2.604）。CP組與對照組，DM組與對照組比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，P>0.017. -1082 G/A位點(diǎn)和-819 C/T位點(diǎn)基因型和等位基因在四組間的分布頻率差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。-1082 G/A位點(diǎn)在四組資料中均未發(fā)現(xiàn)GG基因型?；蛐鸵訟A純合子為主

9、，AG雜合子較少。 對四組資料進(jìn)行性別分層統(tǒng)計(jì)，結(jié)果顯示，在女性受檢者中，IL-10基因啟動子區(qū)-592 C/A位點(diǎn)基因型分布在四組間無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（X2=8.546，P=0.201），等位基因頻率在四組間比較有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（X2=8.051，P=0.045），進(jìn)一步兩兩比較，DP組與對照組比較，等位基因頻率分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（X2=6.144，P=0.013），A等位基因相對于C等位基因OR（95%CI）：=2.049（1.15

10、5～3.636）。CP組與對照組，DM組與對照組比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P>0.017）。-1082 G/A位點(diǎn)和-819C/T位點(diǎn)基因型和等位基因四組間比較無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。男性受檢者中，各位點(diǎn)基因型和等位基因分布在四組間差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P>0.05） 7.IL-10基因各位點(diǎn)間在不同組別的連鎖不平衡分析 IL-10基因啟動子區(qū)-1082 G/A、-819 C/T和-592 C/A位點(diǎn)在各組間均存在較強(qiáng)的連鎖不平衡（

11、D'=1.0）。 8.IL-10基因-1082-819-592位點(diǎn)間在不同組別的單倍體型分析 在2型糖尿病組和健康對照組中，單倍體ATA和ATC的頻率分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（X2=5.688，P=0.017和X2=7.976，P=0.0048），單倍體ATA在2型糖尿病組中頻率高于健康對照組。而單倍體ATC則在健康對照組中頻率明顯高于2型糖尿病組。兩組間總的P值為0.017，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 在慢性牙周炎伴有2型

12、糖尿病組和健康對照組中，單倍體ATA和ATC的頻率分布趨勢同2型糖尿病組和健康對照組間相似：單倍體ATA和ATC的頻率分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，（X2=7.962，P=0.0048和X2=10.659，P=0.0011），單倍體ATA在慢性牙周炎伴有2型糖尿病組中頻率高于健康對照組。而單倍體ATC則在健康對照組中頻率明顯高于疾病組。兩組間總的P值為0.0025，差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 在慢性牙周炎和健康對照組中，各單倍體型的頻率分布在兩

13、組中差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。 結(jié)論: 1.與漢族人群慢性牙周炎遺傳易感性相關(guān)的因素有：VDR BTA單倍體型。 2.與漢族人群2型糖尿病的遺傳易感性相關(guān)的因素有：VDR Bta單倍體型；IL-10單倍體ATA。 3.與漢族人群牙周炎伴有2型糖尿病的遺傳易感性相關(guān)的因素有：IL-10基因啟動子區(qū)-592 C/A位點(diǎn)A等位基因；單倍體ATA。 4.VDR基因單倍體btA和IL-10基因單倍體ATC可能是漢族