維生素D受體,白細胞介素-10基因多態(tài)性與慢性牙周炎和2型糖尿病易感性的關系.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的: 通過對維生素D受體和IL-10基因單核苷酸多態(tài)性與漢族人群慢性牙周炎和2型糖尿病易感性的關系的研究,進一步探討慢性牙周炎與2型糖尿病的共同遺傳背景。 方法: 收集107例重度慢性牙周炎患者、121名牙周健康對照者、64例單純2型糖尿病患者(VDR基因組為64例,IL-10基因組為68例)及96例2型慢性牙周炎伴2型糖尿病患者的頰粘膜拭子,以Chelex-100法提取DNA,采用聚合酶鏈反應-限制性片段長度

2、多態(tài)性(PCR-RFLP)方法測定VDR基因BsmⅠ、ApaⅠ、TaqⅠ、FokⅠ位點和IL-10基因-1082G/A、-819C/T、-592C/A位點的基因型,分析各疾病組與對照組間基因型、等位基因頻率和單倍體頻率分布的差異。 結(jié)果: 1.VDR BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠSNPs檢測結(jié)果及Hardy-Weinberg平衡檢驗 VDR BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠ各位點PCR產(chǎn)物經(jīng)相應

3、的限制性內(nèi)切酶酶切后讀取基因型。隨機抽取10%的樣本,重復檢測基因型結(jié)果與前完全一致。各位點基因型經(jīng)PCR產(chǎn)物測序證實與前完全一致。四組資料的基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(p>0.05)。 2.VDR基因型和等位基因在不同組別分布頻率比較 VDR基因BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠ位點基因型和等位基因分布頻率在四組間差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。其中,TaqⅠ位點在四組受檢者中基因

4、型分布均以TT純合子為主,Tt雜合子較少,tt純合子分別在CP組和DM組中各有一例。BsmⅠ位點在四組受檢者中均未發(fā)現(xiàn)BB基因型,以bb純合子占較大比例,Bb雜合子較少。 對四組資料進行性別分層統(tǒng)計,結(jié)果顯示,VDR基因BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠ位點基因型和等位基因分布頻率在四組間差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。 3.VDR基因各位點間在不同組別的連鎖不平衡分析 在2型糖尿病組和健康對照組中Bsm

5、Ⅰ和TaqⅠ位點間、在牙周炎伴2型糖尿病組和健康對照組中BsmⅠ和ApaⅠ位點間均存在較強的連鎖不平衡(D'>0.5)。 4.VDR基因BsmⅠ、TaqⅠ和ApaⅠ位點間在不同組別的單倍體型分析 在慢性牙周炎組和健康對照組中,單倍體BTA的頻率分布差異有統(tǒng)計學意義,X2=4.219,P=0.040,OR值為4.066,95%CI=0.960~17.231。在2型糖尿病組和健康對照組中,單倍體Bta的分布差異有統(tǒng)計學意義。

6、單倍體btA僅在對照組中出現(xiàn),且差異有統(tǒng)計學意義。在牙周炎伴2型糖尿病組和健康對照組中,單倍體btA亦僅在對照組中出現(xiàn),且差異有統(tǒng)計學意義。在后兩組中其總的P值均<0.05。 5.IL-10-1082 G/A、-819 C/T和-592 C/A SNP檢測結(jié)果及Hardy-Weinberg平衡檢驗 IL-10-1082 G/A、-819 C/T和-592 C/A各位點PCR產(chǎn)物經(jīng)相應的限制性內(nèi)切酶酶切后讀取基因型。隨機

7、抽取10%的樣本,重復檢測基因型結(jié)果與前完全一致。各位點基因型經(jīng)PCR產(chǎn)物測序證實與前完全一致。四組資料的基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(p>0.05)。 6.IL-10基因型和等位基因在不同組別分布頻率比較 IL-10基因啟動子區(qū)-592 C/A位點基因型分布在四組間無統(tǒng)計學差異(X2=9.505,P=0.147),等位基因頻率在四組間比較有統(tǒng)計學差異(X2=8.620,P=0.035),進一

8、步兩兩比較,DP組與對照組間,等位基因頻率分布差異有統(tǒng)計學意義(X2=5.742,P=0.017),A等位基因相對于C等位基因OR(95%CI):=1.692(1.098~2.604)。CP組與對照組,DM組與對照組比較差異均無統(tǒng)計學意義,P>0.017. -1082 G/A位點和-819 C/T位點基因型和等位基因在四組間的分布頻率差異均無統(tǒng)計學意義。-1082 G/A位點在四組資料中均未發(fā)現(xiàn)GG基因型?;蛐鸵訟A純合子為主

9、,AG雜合子較少。 對四組資料進行性別分層統(tǒng)計,結(jié)果顯示,在女性受檢者中,IL-10基因啟動子區(qū)-592 C/A位點基因型分布在四組間無統(tǒng)計學差異(X2=8.546,P=0.201),等位基因頻率在四組間比較有統(tǒng)計學差異(X2=8.051,P=0.045),進一步兩兩比較,DP組與對照組比較,等位基因頻率分布差異有統(tǒng)計學意義(X2=6.144,P=0.013),A等位基因相對于C等位基因OR(95%CI):=2.049(1.15

10、5~3.636)。CP組與對照組,DM組與對照組比較差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.017)。-1082 G/A位點和-819C/T位點基因型和等位基因四組間比較無統(tǒng)計學差異。男性受檢者中,各位點基因型和等位基因分布在四組間差異均無統(tǒng)計學意義(P>0.05) 7.IL-10基因各位點間在不同組別的連鎖不平衡分析 IL-10基因啟動子區(qū)-1082 G/A、-819 C/T和-592 C/A位點在各組間均存在較強的連鎖不平衡(

11、D'=1.0)。 8.IL-10基因-1082-819-592位點間在不同組別的單倍體型分析 在2型糖尿病組和健康對照組中,單倍體ATA和ATC的頻率分布差異有統(tǒng)計學意義(X2=5.688,P=0.017和X2=7.976,P=0.0048),單倍體ATA在2型糖尿病組中頻率高于健康對照組。而單倍體ATC則在健康對照組中頻率明顯高于2型糖尿病組。兩組間總的P值為0.017,差異有統(tǒng)計學意義。 在慢性牙周炎伴有2型

12、糖尿病組和健康對照組中,單倍體ATA和ATC的頻率分布趨勢同2型糖尿病組和健康對照組間相似:單倍體ATA和ATC的頻率分布差異有統(tǒng)計學意義,(X2=7.962,P=0.0048和X2=10.659,P=0.0011),單倍體ATA在慢性牙周炎伴有2型糖尿病組中頻率高于健康對照組。而單倍體ATC則在健康對照組中頻率明顯高于疾病組。兩組間總的P值為0.0025,差異有統(tǒng)計學意義。 在慢性牙周炎和健康對照組中,各單倍體型的頻率分布在兩

13、組中差異無統(tǒng)計學意義。 結(jié)論: 1.與漢族人群慢性牙周炎遺傳易感性相關的因素有:VDR BTA單倍體型。 2.與漢族人群2型糖尿病的遺傳易感性相關的因素有:VDR Bta單倍體型;IL-10單倍體ATA。 3.與漢族人群牙周炎伴有2型糖尿病的遺傳易感性相關的因素有:IL-10基因啟動子區(qū)-592 C/A位點A等位基因;單倍體ATA。 4.VDR基因單倍體btA和IL-10基因單倍體ATC可能是漢族

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